我想在 R 中创建一个相关值矩阵。但是，我没有将参数与其自身进行比较，因此不是典型的 corrplot 是三角形并镜像在对角轴上。我实际上已经有了相关值。
我只是希望招募corrplot函数(来自 corrplot package )，生成如下图像:
我的数据已经包含我想要绘制的相关值，是:
X animal.1 animal.2 animal.3 animal.4 animal.5
1 parameter 1 0.10258087 0.3338782 0.150246554 0.07295133 0.2484152
2 parameter 2 0.04205748 0.4062727 -0.002101464 0.12068818 0.2951127
3 parameter 3 0.11264488 0.4114954 0.067145776 0.13361071 0.3246052
4 parameter 4 -0.02261649 -0.2426341 0.108042167 -0.12820517 -0.2005686
5 parameter 5 -0.01576384 -0.2300852 0.112941655 -0.12391976 -0.1906473
6 parameter 6 -0.09749030 -0.3110920 0.021994297 -0.13570257 -0.2557532
我希望绘图看起来像一个 corrplot，但它将是一个完整的矩形。我想要不同直径的圆圈，正值或负值的两种不同颜色，以及沿着图边的颜色渐变。本质上，我想要一个矩形值表的 corrplot 主题。
我还要求查看是否可以在具有显着 (p<0.05) p 值的网格方块上放置星号。我现在附上 p 值矩阵的 dput 文件
structure(list(X = structure(1:6, .Label = c("parameter 1", "parameter 2",
"parameter 3", "parameter 4", "parameter 5", "parameter 6"), class = "factor"),
Animal.1 = c(0.2454906, 0.63471, 0.2019519, 0.7984066, 0.8587147,
0.2698293), Animal.2 = c(0.000103586, 1.62e-06, 1.15e-06,
0.005412082, 0.008451775, 0.000315107), Animal.3 = c(0.08796553,
0.9810688, 0.447827, 0.2211191, 0.2007585, 0.8038392), Animal.4 = c(0.4094627,
0.1713835, 0.1296492, 0.1460429, 0.1601174, 0.1236984), Animal.5 = c(0.004374306,
0.000653099, 0.00016464, 0.02213469, 0.0298038, 0.003315349
)), .Names = c("X", "animal.1", "animal.2", "animal.3", "animal.4",
"animal.5"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -6L))
最佳答案
我认为您只需要将 df 转换为矩阵，然后运行 corrplot功能。
library(corrplot)
#Transform data to matrix
matrix_cor<-as.matrix(df[,-1])
#Set row names as df first column
row.names(matrix_cor)<-df[,1]
corrplot(matrix_cor,
method = "circle")
关于r - 在 R 中制作相关值的矩形矩阵，可能使用 corrplot，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/60678812/