数据:
CHR SNP BP A1 TEST NMISS BETA SE L95 U95 STAT P
1 chr1:1243:A:T 1243 T ADD 16283 -6.124 0.543 -1.431 0.3534 -1.123 0.14
期望的输出:MarkerName P-Value
chr1:1243 0.14
实际文件是 1.2G 的行,如上我需要将文本的第二列从第二个冒号处剥离,然后将其粘贴到最后的第 12 列并为其指定一个新标题。
我试过了:
awk '{print $2, $12}' | cut -d: -f1-2
但这会删除冒号后的整行,我想保留“p”列我将其输出到一个新文件,然后使用 awk 将其粘贴到 P 值列上,但想知道是否有一种单行方法可以做到这一点?
非常感谢
最佳答案
我以更容易理解的形式发表评论:
$ awk '
BEGIN {
print "MarkerName P-Value" # output header
}
NR>1 { # skip the funky first record
split($2,a,/:/) # split by :
printf "%s:%s %s\n",a[1],a[2],$12 # printf allows easier output formating
}' file
输出:MarkerName P-Value
chr1:1243 0.14
关于bash - 使用 awk 重新格式化文本文件并将其剪切为单行,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/64821030/