r - 如何在Windows R上设置和使用MPI

Question

我从网上下载了一个R脚本，说它“必须在MPI环境中运行”。现在，我几乎不了解MPI，只是它用于并行计算，而且很难找到有关如何设置和使用它的简单教程。
有人可以给我一份简单，循序渐进的指南，以介绍如何安装该脚本，如何执行该脚本以及如何运行该脚本吗？
提前致谢。
编辑，这是我尝试过的:

我安装了Microsoft MPI

我在R

中安装并加载了RMpi软件包

具体问题:

> # number of available slots is passed via environment variable
> slots <- as.integer(Sys.getenv("NSLOTS"))

给出NA_integer_。
如果我使用以下代码(即我将Sys.getenv(“NSLOTS”)替换为标量)

> slots <- as.integer(4)
> cl <- snow::makeMPIcluster(slots)

我得到了错误

Error in mpi.comm.spawn(slave = mpitask, slavearg = args, nslaves = count, : Other MPI error, error stack: MPI_Comm_spawn(cmd="C:/PROGRA~1/R/R-31~1.0/bin/Rscript.exe", argv=0x0000000009A12CA8, maxprocs=4, MPI_INFO_NULL, root=0, MPI_COMM_SELF, intercomm=0x000000000A2FF8B0, errors=0x00000000100E3C70) failed Function not implemented

因此，我怀疑我没有正确配置我的MPI环境。

Answer 1

试试这行，...

> require(parallel) 
> nCores <- 8  # manually for non-cluster machines
> cl <- makeCluster(nCores) # by default this uses the PSOCK mechanism as in the SNOW package