r - R 中具有复杂函数和 plyr 的 tryCatch

Question

我有一个复杂的长函数，我用它来进行模拟。它可能会产生错误，主要与最终具有零方差的相等值的随机向量有关，被输入到 PCA 或逻辑回归中。

我正在使用 doMC 和 plyr 在集群上执行它。我不想tryCatch函数内部的每一个小事情，因为错误的可能性很多，而且每个错误的概率都很小。

如何 tryCatch 每次运行，而不是 tryCatch 处理每一行？代码是这样的:

iteration = function(){
    a really long simulation function where errors can happen
    }
reps = 10000
results = llply(1:reps, function(idx){out<-iteration()},.parallel=TRUE)

大约一年后编辑: foreach 包使这比使用 plyr

更容易

library(foreach)
output <- foreach(i=1:reps, .errorhandling = 'remove')%dopar%{
  function
}

Answer 1

您可以将 try catch 循环包装在传递给 llply 的函数中吗？

results = llply(1:reps, function(idx){
    out = NA
    try({ 
        out<-iteration()
    }, silent=T)
    out
},.parallel=TRUE)