python-3.x - 从 Jenkinsfile 中的 docker 镜像激活 conda 环境

Question

我试图在我的 Jenkinsfile 中激活一个 conda 环境，它是从 Dockerbuild 创建的，但我不知道如何在我的 Jenkinsfile 的 shell 脚本中激活环境。

但是这一行 。/opt/conda/envs/myapp-env/bin/activate 在我的 Jenkinsfile 中激活失败

Dockerfile

FROM continuumio/miniconda3:latest

WORKDIR /tmp/app

COPY environment.yml environment.yml

#missing dependencies

RUN conda config --add channels conda-forge \ 
  && conda env create -n myapp-env -f environment.yml \
  && rm -rf /opt/conda/pkgs/*

ENV PATH /opt/conda/envs/myapp-env/bin:$PATH

RUN echo $PATH
RUN conda env list

Jenkins 文件:

try {
        stage('Activate environment & Unit Test') {
            buildImage.inside {

                sh '''
                echo $PATH
                echo $HOME
                . /opt/conda/envs/myapp-env/bin/activate && python -m pytest tests --cov ./server --cov-report term-missing --cov-report xml --junitxml=build/results.xml
                '''
            }
        }

回显 $PATH 和 $HOME 的结果:

Running shell script
+ echo /opt/conda/envs/dfog-app/bin:/opt/conda/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin
/opt/conda/envs/myapp-env/bin:/opt/conda/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin
+ echo /

Answer 1

你得到的错误信息可能是

CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'.

因为 continuumio/miniconda3:latest 图像仅为 root 用户设置了一切，这不是 Jenkins 运行的方式。

为了能够激活环境，您首先需要source/opt/conda/etc/profile.d/conda.sh。

但是，您随后可能会遇到各种其他权限问题，因为 conda 不能以任何其他用户身份运行，而 Jenkins 不能以 root 用户身份运行。