r - 如何解决 R Markdown (Knit) "'closure' is not subsettable"？

Question

我第一次尝试使用 RMarkdown (Knit) 来生成 pdf。默认文件(文件 > 新建文件 > R Markdown)运行良好，编译时显示生成的 pdf。例如，下面的代码运行，

```{r cars}
summary(cars)
```

但是，如果我只是使用“myData”更改汽车，它不会编译并显示，

Error in object[[i]] : object of type 'closure' is not subsettable
Calls: <Anonymous> ... withVisible -> eval -> eval -> summary -> summary.default
Execution halted

我在全局环境中加载了“myData”，并且可以在原始 R 脚本中执行其他操作。有人可以提供一些指导。非常感谢您的宝贵时间。

Answer 1

运行 Rmarkdown 文件会启动一个新的 R session 。

在新 session 中，您可以加载存储在 data 中的 data.frames。包，但其他数据集必须从 Rmarkdown 文档中加载。

要让 myData 显示在您的 Rmarkdown 文档中，

使用 save 将文件保存在某处在您当前的 R session 中

然后在你的 Rmarkdown 文档中，使用 load打开数据集

因此，在您当前的 R session 中:

save(myData, file="<path>/myData.Rdata")

并在您的 Rmarkdown 文件中:

```{r myDataSummary}
load("<path>/myData.Rdata")
summary(myData)
```

如果您的数据存储为文本文件，并且您不想存储单独的 .R 文件，请使用 read.csv或直接在您的 Rmarkdown 文件中添加好友。

```{r myDataSummary}
myData <- read.csv("<path>/myCSV.csv")
summary(myData)
```