r - lapply 和 for 循环通过 R 中的 data.frames 列表运行函数

Question

我有一个 data.frame 列表，我想通过每个 data.frame 运行 cor.test。 data.frame 有 8 列，我想针对第 8 列的前 7 列中的每一列运行 cor.test。

我首先设置存储数据的列表

estimates = list()
pvalues = list()

然后是结合lapply的循环

for (i in 1:7){
  corr <- lapply(datalist, function(x) {cor.test(x[,i], x[,8], alternative="two-sided", method="spearman", exact=FALSE, continuity=TRUE)}) 
  estimates= corr$estimate
  pvalues= corr$p.value
}

它运行没有任何错误，但estimates 显示NULL

哪一部分出了问题？我曾经在 cor.test 上运行 for 循环，或者使用 lapply 运行，从不将它们放在一起。我想知道是否有解决方案或替代方案。谢谢。

Answer 1

我们可以使用 sapply，以 mtcars 上的示例显示，其中 cor.test 是针对第一列对所有列执行的。

lst <- list(mtcars, mtcars) 

lapply(lst, function(x) t(sapply(x[-8], function(y) {
   val <- cor.test(y, x[[8]], alternative ="two.sided", 
            method="spearman", exact=FALSE, continuity=TRUE)
          c(val$estimate, pval = val$p.value)
})))

[[1]]
#            rho         pval
#mpg   0.7065968 6.176953e-06
#cyl  -0.8137890 1.520674e-08
#disp -0.7236643 2.906504e-06
#hp   -0.7515934 7.247490e-07
#drat  0.4474575 1.021422e-02
#wt   -0.5870162 4.163577e-04
#qsec  0.7915715 6.843882e-08
#am    0.1683451 3.566025e-01
#gear  0.2826617 1.168159e-01
#carb -0.6336948 9.977275e-05

#[[2]]
#            rho         pval
#mpg   0.7065968 6.176953e-06
#cyl  -0.8137890 1.520674e-08
#.....

这将返回两列矩阵的列表，其中分别包含 estimate 和 p.value。