R 编程 : read. csv() 意外跳过行

Question

我正在尝试使用 read.csv() 在 R(在 linux 下)中读取 CSV 文件。函数完成后，我发现在 R 中读取的行数小于 CSV 文件中的行数(通过 wc -l 获得)。此外，每次我阅读特定的 CSV 文件时，总是会跳过相同的行。我检查了 CSV 文件中的格式错误，但一切看起来都很好。

但是如果我将被跳过的行提取到另一个 CSV 文件中，那么 R 就能够从该文件中读取非常多的行。

我无法在任何地方找到我的问题所在。非常感谢任何帮助。

Answer 1

这是一个使用 count.fields 来确定查找位置并可能应用修复的示例。您有少量宽度为 23 个“字段”的行:

> table(count.fields("~/Downloads/bugs.csv", quote="", sep=","))
     2     23     30 
   502     10 136532 
> table(count.fields("~/Downloads/bugs.csv", sep=","))
# Just wanted to see if removing quote-recognition would help.... It didn't.
     2      4     10     12     20     22     23     25     28     30 
 11308     24     20     33    642    251     10      2    170 124584 
> which(count.fields("~/Downloads/bugs.csv", quote="", sep=",") == 23)
 [1] 104843 125158 127876 129734 130988 131456 132515 133048 136764
[10] 136765

我看着 23:

txt <-readLines("~/Downloads/bugs.csv")[
                 which(count.fields("~/Downloads/bugs.csv", quote="", sep=",") == 23)]

并且他们有八角符号(“#”，井号)，在 R 数据用语中是注释字符。

> table(count.fields("~/Downloads/bugs.csv", quote="", sep=",", comment.char=""))
    30 
137044 

所以....在 read.table 中使用这些设置，您应该“一切顺利”。