r - 将一个目录中的大量文件合并到R中的数据框中

Question

我在一个目录中有大量数据文件 (>1000)。我想将它们全部合并到 R 中的一个数据框中。它们都具有相同数量和类型的列。 到目前为止，我所拥有的是:

setwd("directory")
files <- list.files()
for (i in 1:length(files)) assign(files[i], read.csv(files[i]))

这会为 1000 多个文件中的每一个创建数据框。有没有办法合并它们，而不必输入所有 1000 多个文件名的列表？

如有任何帮助，我们将不胜感激!

Answer 1

使用 data.table 执行此操作的标准方法(因其速度而推荐)是:

library(data.table)
data <- rbindlist(lapply(list.files(), fread))

还有一些额外的功能，例如

rbindlist(lapply(list.files(), fread), fill = TRUE)

将处理您的一些或许多文件具有不同列名称的可能性——在那些缺少该列的文件中，任何非重叠都将用 NA 填充。

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编辑:正如@nicola 提到的，除非您真的知道自己在做什么，否则一般应避免使用assign。

参见 this发布以进一步引用。