macos - MacOSX El Capitan上安装Biopython，gcc报错-Qunused-arguments

Question

我正在尝试安装 Biopython，但出现此错误:

> gdr$ python setup.py build running build running build_py running
> build_ext building 'Bio.cpairwise2' extension gcc -DNDEBUG -g -fwrapv
> -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -Qunused-arguments -Qunused-arguments -I/Applications/Canopy.app/appdata/canopy-1.7.2.3327.macosx-x86_64/Canopy.app/Contents/include/python2.7
> -c Bio/cpairwise2module.c -o build/temp.macosx-10.6-x86_64-2.7/Bio/cpairwise2module.o gcc: error:
> unrecognized command line option ‘-Qunused-arguments’ gcc: error:
> unrecognized command line option ‘-Qunused-arguments’ error: command
> 'gcc' failed with exit status 1

我运行的是 MacOSX El Capitan 10.11.3，gcc 版本 4.9.2 20141029(预发行版)。 似乎没有其他人在 stackoverflow 和谷歌上报告过这个问题(进行了快速搜索)。

(更新)解决方案:

我解决了编辑 setup.py 安装文件中的 os_clang_fix()，注释:

#    for flag in ["CFLAGS", "CPPFLAGS"]:
#        if flag not in os.environ:
#            os.environ[flag] = "-Qunused-arguments"
#        elif "-Qunused-arguments" not in os.environ[flag]:
#            os.environ[flag] += " -Qunused-arguments"

Answer 1

这是 clang 特定的选项，据我所知，它在 gcc 中不可用。

来自 clang 联机帮助页:

   -Qunused-arguments
       Don't emit warning for unused driver arguments.

你 [至少] 有两个选择来解决这个问题:

• 删除项目构建文件周围出现的任何 Qunused-arguments(我真的不推荐这个)。
• 安装 clang(只需在终端上运行 clang 并按照安装说明进行操作)。

还有[个人意见]，如果你因为任何特殊原因不需要gcc，卸载它，并在你的OSX上保留clang，因为它看起来是Apple 的愿​​望:)。