r - ggplot2 中密度图叠加中的警告消息

Question

我正在尝试通过编写两个数据集(不同大小)的密度图:

data1 <- data.frame(dens = log2(c(tmm.th[,1],bidrar_mest[,1]))
                  , lines = c(rep("all",61893),rep("loaded",50) ))

ggplot(data1, aes(x = dens, fill = lines)) + geom_density(alpha = 0.5)

我得到一个很好的图表，显示较小的数据集具有较高的值，但我也收到一条警告消息:

Warning message: Removed 35492 rows containing non-finite values
(stat_density).

有人可以解释为什么以及如何摆脱它吗？

Answer 1

正如@Ant 和@alexwhan 已经指出的，问题可能是由于:

• 负数或等于零的点。在第二种情况下，对数转换将给出输出 -Inf，然后在分析中将其丢弃。
• 超出规定范围的点。

由于在您的情况下 x 轴或 y 轴的限制不是先验设置的，我会说原因是第一个。

请参阅以下链接以获得进一步的解释:

• http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=23961 (相对于第一种情况)
• How to set limits for axes in ggplot2 R plots? (相对于第二个)。

希望对您有所帮助。