我在生存对象中使用 autoplot()
时遇到了一些麻烦。我将以下面为例
library(ggplot2)
library(ggfortify)
library(survival)
datalung <- lung
fitlung<- survfit(Surv(time,status) ~ sex,type = "kaplan-meier",data=datalung)
autoplot(fitlung,conf.int=FALSE,pVal=TRUE,pX=800)+scale_color_grey()
在上面的示例中,性别 1 和性别 2 具有不同的灰度,只有 2 个组可以看到不同的组。
我使用的真实数据集有 9 个不同的组,很难看到具有这种灰度的差异曲线。我不能使用颜色。我正在寻找一种将符号放入不同组的方法,但我在 autoplot
中找不到此参数。
surv.linetype
有选项solid
和dashed
,但它会改变所有具有相同模式的曲线,我不想要它.以肺
数据为例,我想为性别1和性别2设置不同的线型
。
最佳答案
查看功能代码通常可以帮助我弄清楚哪些可以更改,哪些不能更改。您可以通过在控制台中运行 ggfortify:::autoplot.survfit
查看 autoplot.survfit
的代码。
仔细查看,您会看到只有 color
美学用于分组。我没有看到更改它的简单方法,但您可以轻松地按照函数中的配方来制作自己的图。虽然构建您自己的地 block 需要更多步骤,但它为您提供了很大的灵 active 。
例如,如果您想更改每个组的线和点的形状,您可以强化
模型,然后构建绘图。
plot.data = fortify(fitlung, surv.connect = TRUE)
ggplot(plot.data, aes(time, surv, shape = strata)) +
geom_step(aes(linetype = strata)) +
geom_point(data = subset(plot.data, n.censor > 0)) +
scale_y_continuous(labels = scales::percent)
请注意,我只知道 6 种线型;即使有更多,也很难区分。形状也好不到哪里去,尽管形状更多。
关于r - 如何在自动绘图中放置不同的符号,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/39907004/