r - : polygon edge not found疑难解答

Question

有谁知道这个错误信息是什么意思？我尝试将字体更改为 Helvetica，然后它适用于小数据框。但是，当我尝试绘制大型数据框时，错误再次出现。

我在 Mac 上使用 RStudio

> head(Merged_Columns.m)
    SYMBOL Cond variable    value
1    Baz2b    T       0h  40.5629
2     Tpm4    T       0h  44.8539
3    H2-K1    T       0h 218.9180
4    Usp22    T       0h  23.6377
5     Mreg    T       0h  95.8775
6 Arhgap30    T       0h  40.1333

p <- ggplot(Merged_Columns.m, aes(variable, value, colour=Cond)) + geom_point() 
p + theme_bw(base_family= 'Helvetica') + facet_wrap(~SYMBOL,ncol = 2) + scale_y_continuous(trans = log2_trans(),
                                                      breaks = trans_breaks("log2", function(x) 2^x),
                                                      labels = trans_format("log2", math_format(2^.x))) +
 theme(axis.text.x  = element_text(angle=90)) +
  labs(title="10 > CPM > 8", x= "Time (h)" , y= "Expression (log2)")


Error in grid.Call(L_textBounds, as.graphicsAnnot(x$label), x$x, x$y,  : 
  polygon edge not found

Answer 1

我可以在您的小样本(Mac 1.2.5019 上的 RStudio)上间歇性地重现您的错误。

问题可能与 this issue 相同，这指出了在底层图形代码中将表达式显示为标签的一些低级错误，特别是使用 math_format()和上标。自您的原始帖子以来，此问题已受到维护者的一些关注和增量修复——尽管它可能尚未 100% 解决。

你该怎么办？

确保您使用的是最新的 RStudio，以确保您从 future 的错误修复中受益。

在 ggplot2 中使用某些表达式来形成标签时要小心。

这不是解决方案，但如果您放弃 labels = ...论点完全来自您的 scale_y_continuous() ，或选择其他格式，希望您不会收到同样的错误。

SO( Error in grid.Call(L_textBounds, as.graphicsAnnot(x$label), x$x, x$y, : Polygon edge not found )上的字体可用性还有另一个问题，尽管该错误消息有其他警告并且在您的示例中似乎没有错。