我有这个 data.frame具有相等长度的组 ( id )
id | amount
--------------
A | 10
A | 54
A | 23
B | 34
B | 76
B | 12
我想转置 按组
id对此: id |
----------------------
A | 10 | 54 | 23
B | 34 | 76 | 12
这样做的最有效方法是什么？
我以前用过
reshape和 dcast但他们确实很慢! (我有很多数据，很想加快这个瓶颈)有没有更好的策略？使用
data.table还是矩阵？？任何帮助将非常感激!# Little data.frame
df <- data.frame(id=c(2,2,2,5,5,5), amount=as.integer(c(10,54,23,34,76,12)))
# Not so little data.frame
set.seed(10)
df <- data.frame(id = rep(sample(1:10000, 10000, replace=F),100), amount=as.integer(floor(runif(1000000, -100000,100000))))
# Create time variable
df$time <- ave(as.numeric(df$id), df$id, FUN = seq_along)
# The base R reshape strategy
system.time(df.reshape <-reshape(df, direction = "wide", idvar="id", timevar="time"))
user system elapsed
6.36 0.31 6.69
# The reshape2 dcast strategy
require(reshape2)
a <- system.time(mm <- melt(df,id.vars=c('id','time'),measure.vars=c('amount')))
b <- system.time(df.dcast <- dcast(mm,id~variable+time,fun.aggregate=mean))
a+b
user system elapsed
14.44 0.00 14.45
更新
利用每组长度相等的事实，您可以使用
matrix -功能。df.matrix <- data.frame(id=unique(df$id), matrix(df$amount, nrow=(length(unique(df$id))), byrow=T))
user system elapsed
0.03 0.00 0.03
注意:此方法假设 data.frame 由
id 预先排序.
最佳答案
矩阵方法将使用:
system.time({ df.reshape <-matrix(df$amount, nrow=10000, byrow=TRUE);
rownames(df.reshape)<- df$id[1:10000]
} )
user system elapsed
0.010 0.006 0.016
关于r - 如何按组加速转置data.frame？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/14627096/