julia - 在 Julia 中调整 HDF5 数据集的大小

Question

有没有办法使用 Julia 的 HDF5.jl 在 HDF5 中调整分块数据集的大小？我在文档中没有看到任何内容。查看源代码，我发现的只有set_dims!() ，但这不能扩展数据集(只能缩小它)。 HDF5.jl 是否能够放大现有(分块)数据集？这对我来说是一个非常重要的功能，我宁愿不必调用另一种语言。

Answer 1

我相信我已经弄清楚了。问题是我忘记给数据空间一个足够大的 max_dims。这样做需要深入研究较低级别的 API。我找到的解决方案是:

dspace = HDF5.dataspace((6,20)::Dims, max_dims=(6,typemax(Int64)))
dtype = HDF5.datatype(Float64)
dset = HDF5.d_create(prt, "trajectory", dtype, dspace, "chunk", (6,10))

一旦我创建了一个可以适当调整大小的数据集，set_dims!函数正确调整数据集的大小。

我想我找到了 API 的一些小问题，我必须在本地版本中解决或更改这些问题。我会就这些问题与 HDF5.jl 所有者联系。对于那些有兴趣的人:

常数H5S_UNLIMITED类型为 Uint64 ，但 dataspace函数只接受 Int64 的元组，这就是为什么我使用 typemax(Int64)我的 max_dims如何模仿H5S_UNLIMITED是派生的。

d_create表格我使用的电话 h5d_create错误地；它通过 parent而不是 checkvalid(parent).id (与其他形式的 d_create 对比可以看出)。