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我试图找出一个错误,该错误阻止我使用 RcppArmadillo 制作 R 包“whyNotWork”。该包仅包含一个 .cpp 文件,其中包含一个返回矩阵特征值的简单函数:
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::export]]
arma::vec getEigenValues(arma::mat M)
{
return arma::eig_sym(M);
}
在描述文件中,我添加了:
Imports:
Rcpp (>= 0.12.1), RcppArmadillo
LinkingTo:
Rcpp, RcppArmadillo
Depends: RcppArmadillo
在 NAMESPACE 文件中,我添加了:
exportPattern("^[[:alpha:]]+")
useDynLib(whyNotWork)
import(RcppArmadillo)
importFrom(Rcpp, evalCpp)
如果我没有尝试制作包,该功能可以正常工作——“源”按钮将成功加载该功能并且它可以正常工作。但是,在制作包时,点击“Build & Reload”按钮会出现以下错误:
arma.o:arma.cpp(.text$_ZN4arma6auxlib7eig_symIdNS_3MatIdEEEEbRNS_3ColIT_EERKNS_4BaseIS5_T0_EE[_ZN4arma6auxlib7eig_symIdNS_3MatIdEEEEbRNS_3ColIT_EERKNS_4BaseIS5_T0_EE]+0x28d): undefined reference to `dsyev_'
我在谷歌上搜索了“dsyev”,它似乎与 LAPCAK 有关。
一个办法:
在 src 文件夹中新建一个 .txt 文件。添加
PKG_LIBS = $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)
在文件中。
将 txt 文件重命名为 Makevars.win(如果不是 Windows 系统,则没有 .win)。打包成功。
通过比较
RcppArmadillo.package.skeleton()
生成的文件找到解决办法以及来自 Rstudio 的那些
最佳答案
你的操作系统是什么?
什么R CMD config LAPACK_LIBS
返回?
您是自己构建 R 还是下载了二进制文件?
在大多数系统(Linux、OS X 等)上,R 将使用外部 LAPACK 库。在 Windows 上,它可能使用它自己的(减少的)LAPACK 副本,该副本缺少某些功能。
值得一提的是,您的程序在我的系统上使用外部 LAPACK 库构建得很好:
R> sourceCpp("/tmp/arma_sym.cpp")
R> v <- 1:4; getEigenValues(v %*% t(v))
[,1]
[1,] -2.33587e-15
[2,] 0.00000e+00
[3,] 2.33587e-15
[4,] 3.00000e+01
R>
关于r - 在 Rstudio 中使用 RcppArmadillo 制作 R 包遇到错误 "undefined reference to dsyev",我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/34186508/