我正在构建一个广泛使用子文档的报告基础结构(通过 {r, child = 'somedir/child_doc.Rmd'}
)并通过 params
参数化YAML
中的字典主文档的标题。一个例子可能是:
---
title: Project Report
subtitle: POIGNANT DESCRIPTION OF THE WORK AT HAND
date: '`r format(Sys.time(), "%d %B, %Y")`'
output:
bookdown::pdf_document2:
template: ~
toc: yes
toc_depth: 2
colorlinks: yes
fontsize: 11pt
documentclass: scrartcl
geometry: margin=1in, a4paper
params:
submodule:
value:
intro:
data_dir: 'data'
---
使用这种结构,访问
data_dir
由于主文档和子文档的工作目录不同,因此变得有问题,因此相对路径定义也不同。出路是:data_dir
时使用绝对/扩展路径名. 快速变长/笨拙。 params
的后处理对象以扩展主文档中的路径。如params
从 R
内部访问时是不可变的 block ,这只能在 中解决不雅方式:```{r params-processing, include = FALSE}
local_params <- params
local_params$submodule$intro$data_dir <- path.expand(local_params$submodule$intro$data_dir)
其次是
local_params
的内部使用而不是 params
. !R path.expand('data')
的路径就地扩展在 YAML
中定义参数时标题。虽然这(或基于 ` 的等价物)适用于 data
示例中的字段 knitr
学习 失败 在路径情况下为 R
表达式未扩展,但用作字符表示 - 和文字 "path.expand('data')"
显然不作为路径存在。 我很感激任何关于如何巧妙地解决这个问题的提示 - 特别是 3. 是否可以工作......
最佳答案
source code of r-yaml
(由 bookdown::render_book
隐式调用)表明您可以通过使用 expr
解析相对路径来相当容易地解决选项 3。标签:
params:
submodule:
value:
intro:
data_dir: !expr normalizePath('data')
这会评估 YAML 中的 R 表达式,不需要任何进一步的处理。
data_dir: !r normalizePath('data')
也是可接受的语法,由 knitr
处理.不幸的是,!R
都没有。或 `r
,你试过的两个,都被解释了。我还建议使用
normalizePath
相反,因为它返回给定任何相对目录的绝对路径。您使用 path.expand
的示例仅执行波浪号扩展,因此对局部相对路径没有影响,例如 'data'
. normalizePath
实际调用path.expand
作为第一步。像往常一样简单地访问完全扩展的路径
```{r params-processing}
print(params$submodule$intro$data_dir)
```
## $value
## [1] "/Users/user_name/full_path_to_book/my_book/data"
##
## $expr
## [1] "normalizePath('data')"
##
## attr(,"class")
## [1] "knit_param_expr"
注意,最好使用
!r
视为 r-yaml
行为可能会改变,因为它当前会引发警告:Warning message:
In yaml.load(readLines(con), error.label = error.label, ...) :
R expressions in yaml.load will not be auto-evaluated by default in the near future
关于r - `bookdown`/`rmarkdown`/`knitr` : Child documents and path definition in `YAML` headers,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/47654521/