r - 根据字符串长度过滤行名称

Question

这个问题在这里已经有了答案:





Remove all rows where length of string is more than n

(4 个回答)


3年前关闭。




我想过滤包含长于 35 且短于 10 的行名的行。
我在看 nchar功能。

                                    79_CGTACG.collapsed.gz 80_ACAGTG.collapsed.gz
CACCCGCACGTATAGACGGACA                                   0                      0
GTGCTGATGTCCTTGGCAGGCTTCGGCCGTCCGGC                      0                      0
CGTGGAACCTG                                              0                      0
TAATGGTCATTAG                                            2                      1
GGCGATGCGGGATGAACCGAAC                                   0                      0
AAGGATGT                                                 0                      0

Answer 1

我认为你的想法是使用 nchar()很好。这可以应用于rownames()并结合数据框的逻辑设置:

df1[nchar(rownames(df1)) > 35 | nchar(rownames(df1)) < 10,]
#         X79_CGTACG.collapsed.gz X80_ACAGTG.collapsed.gz
#AAGGATGT                       0                       0

数据

 df1 <- structure(list(X79_CGTACG.collapsed.gz = c(0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 
0L), X80_ACAGTG.collapsed.gz = c(0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L)), 
 .Names = c("X79_CGTACG.collapsed.gz", "X80_ACAGTG.collapsed.gz"), 
  class = "data.frame", row.names = c("CACCCGCACGTATAGACGGACA", 
  "GTGCTGATGTCCTTGGCAGGCTTCGGCCGTCCGGC", "CGTGGAACCTG", "TAATGGTCATTAG", 
 "GGCGATGCGGGATGAACCGAAC", "AAGGATGT"))