R:在可行的情况下进行快速(有条件)子集化

Question

我想对我的数据行进行子集化

library(data.table); set.seed(333); n <- 100
dat <- data.table(id=1:n, x=runif(n,100,120), y=runif(n,200,220), z=runif(n,300,320))

> head(dat)
   id        x        y        z
1:  1 109.3400 208.6732 308.7595
2:  2 101.6920 201.0989 310.1080
3:  3 119.4697 217.8550 313.9384
4:  4 111.4261 205.2945 317.3651
5:  5 100.4024 212.2826 305.1375
6:  6 114.4711 203.6988 319.4913

在几个阶段。我知道我可以申请 subset(.)依次实现这一点。

> s <- subset(dat, x>119)
> s <- subset(s, y>219)
> subset(s, z>315)
   id        x        y        z
1: 55 119.2634 219.0044 315.6556

我的问题是我需要自动执行此操作，并且可能会发生子集为空的情况。在这种情况下，我想跳过导致空集的步骤。例如，如果我的数据是

dat2 <- dat[1:50]
> s <-subset(dat2,x>119)
> s
   id        x        y        z
1:  3 119.4697 217.8550 313.9384
2: 50 119.2519 214.2517 318.8567

第二步subset(s, y>219)会出现空的，但我仍然想应用第三步 subset(s,z>315) .有没有办法仅在导致非空集时应用子集命令？我想像 subset(s, y>219, nonzero=TRUE) .我想避免像这样的结构

s <- dat
if(nrow(subset(s, x>119))>0){s <- subset(s, x>119)}
if(nrow(subset(s, y>219))>0){s <- subset(s, y>219)}
if(nrow(subset(s, z>318))>0){s <- subset(s, z>319)}

因为我担心如果-那么丛林会相当慢，特别是因为我需要使用 lapply(.) 将所有这些应用于列表中的不同 data.tables | .这就是为什么我希望找到针对速度进行优化的解决方案。

附注。我只选了subset(.)为清楚起见，解决方案例如如果不是更多的话，data.table 也同样受欢迎。

Answer 1

我同意康拉德的回答，即这应该发出警告或至少报告以某种方式发生的事情。这是一种利用索引的 data.table 方式(有关详细信息，请参阅包小插图):

f = function(x, ..., verbose=FALSE){
  L   = substitute(list(...))[-1]
  mon = data.table(cond = as.character(L))[, skip := FALSE]

  for (i in seq_along(L)){
    d = eval( substitute(x[cond, verbose=v], list(cond = L[[i]], v = verbose)) )
    if (nrow(d)){
      x = d
    } else {
      mon[i, skip := TRUE]
    }    
  }
  print(mon)
  return(x)
}

用法

> f(dat, x > 119, y > 219, y > 1e6)
        cond  skip
1:   x > 119 FALSE
2:   y > 219 FALSE
3: y > 1e+06  TRUE
   id        x        y        z
1: 55 119.2634 219.0044 315.6556

verbose 选项将打印 data.table 包提供的额外信息，因此您可以查看何时使用索引。例如，使用 f(dat, x == 119, verbose=TRUE) ， 我看到了。

because I fear the if-then jungle would be rather slow, especially since I need to apply all of this to different data.tables within a list using lapply(.).

如果是非交互式使用，最好让函数返回 list(mon = mon, x = x)更轻松地跟踪查询是什么以及发生了什么。此外，可以捕获并返回详细的控制台输出。