r - 如何以其他名称安装 R 包？

Question

我在 Red Hat Enterprise Linux 6 上使用 R 3.4.1。我有 3.0 版的软件包 asreml安装在 /tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library 下.

> library(asreml)
Loading required package: lattice
Checking for license <redacted>

> .libPaths()
[1] "/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library"

该软件包的第 4 版现已发布，但我们想将第 3 版与第 4 版的结果进行比较。为此，我们希望将第 4 版安装在我们的系统上，名称为 asreml4 .我已经下载了最新版本的 *tar.gz 文件，但如果我这样做了

R CMD INSTALL asreml_4.1.0.93.tar.gz

它安装在 asreml文件夹，覆盖旧版本。那不是我想要的。

我也尝试将它安装在另一个地方，将文件夹重命名为 asreml4 ，然后将该文件夹复制到 /tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library然后尝试加载它，但它加载了错误的版本:

> library(asreml, lib.loc="/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library/asreml4")
> packageVersion("asreml")
[1] ‘3.0.1’

那么，我如何将它安装在 asreml4 中？文件夹的方式，我可以用 library(asreml4) 调用它?

Answer 1

1) 编辑说明 下载源代码，编辑描述文件以使用不同的名称，然后构建并安装它。

2) 独立库或者将新版本安装到单独的库中，然后使用其中之一来获取所需的版本:

library(asreml, lib = ...)
library(asreml)

2a) .libPaths 一个变体是使用 .libPaths(new)要更改默认库路径，请发出

library(asreml)

然后把它改回来。

2b) 开发模式 完成库切换的一种简单方法是使用 dev_mode()不带参数(来自 devtools 包)。后第一dev_mode()命令发出后，默认库变为 ~/R-dev 。此时使用普通 install.packages 安装新版本的 asrmel命令不指定 lib=它将被安装到 ~/R-dev 中。使用 library 加载它不指定库将导致它首先查看 ~/R-dev 。然后测试一下，最后当你准备好切换回原始库和原始 asreml 问题时 dev_mode()再次。 dev_mode()操作默认库路径，以便您可以使用 .libPaths()不带参数随时检查当前默认值是什么。

library(devtools)
dev_mode() # ~/R-dev now default library
# ...
dev_mode() # restore usual default library