r - YAML 中用于 rmarkdown 的内联 R 代码不运行

Question

在获取 rmarkdown 之前，我试图在 YAML 前端运行内联 R 代码运行文件。但是它对我不起作用。下面是一个例子:

---
title: "**Title**"
classoption: xcolor=dvipsnames
output:
  beamer_presentation:
      slide_level: 2
      pandoc_args: [
        "--bibliography", "`r paste('path/to/bib')`"
        ]
---

<!-- slide 1 -->
## Intro ##

这会引发错误:

pandoc-citeproc: could not find `r paste('path/to/bib')`

这是一个简单的例子，但突出了我的主要问题。如何让 rmarkdown 在 YAML 前端运行内联 R 代码？

这是与这些问题类似的问题:

Manipulate RMarkdown metadata from within R code chunks

YAML current date in rmarkdown

Answer 1

这就是我解决这个问题的方法。我从 RStudio 编织。奇怪的是，我不得不对日期和 csl 字段使用一种解决方案，对引用书目字段使用不同的解决方案。 !expr 在 date 或 csl 行中不起作用(对我而言)。并且引用的 r 代码在引用书目行中不起作用(对我而言)。我在一个包(inst/docs 文件夹)中有引用书目和 csl 文件。 rmarkdown 文件(不属于该包的一部分)使用这些文件。

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title: "Title"
date: '`r format(Sys.time(), "%d %B, %Y")`'
output: html_document
bibliography: !expr system.file("docs", "my.bib", package = "MyPackage")
csl: '`r system.file("docs", "my.csl", package = "MyPackage")`'
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# Introduction

Yada yada [@MyRef04].

# References

my.bib 是带有 MyRef04 的 BibTex 文件。 csl 是样式文件

在这种情况下，一个人维护一个包，其中包含数据、代码、引用书目等。包编写者可能不知道的其他人从 GitHub 安装该包并编写或运行使用该包的 rmarkdown 文件。用户几乎肯定不使用 Git 或 GitHub，我不希望他们在从 GitHub 安装软件包后必须下载任何额外的文件。

更新:发布上述内容后，我碰巧从 GitHub 安装了 Markdown，因为我需要开发版本中的一些东西。使用 GitHub 上 rmarkdown 的“1.7.5”版本，您可以在引用书目行中使用 r 代码:

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title: "Title"
date: '`r format(Sys.time(), "%d %B, %Y")`'
output: html_document
bibliography: '`r system.file("docs", "my.bib", package = "MyPackage")`'
csl: '`r system.file("docs", "my.csl", package = "MyPackage")`'
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从 GitHub 安装 rmarkdown

library(devtools)
install_github("rstudio/rmarkdown")