我认为这是 Stack Overflow 上一个完全独特的问题。首先是一些背景:
有人要求我在名为 BRCAPRO (brack-a-pro) 的计算引擎之上编写一个新的 GUI。 BRCAPRO 基于名为 BayesMendel 的软件实现孟德尔计算模型。专门从事癌症治疗的医生和外科医生使用 BRCAPRO 计算向患者展示:
- 根据遗传和家族史被诊断出患有癌症的概率。
- 基于不同治疗形式和/或开始这些治疗的年龄的预期生命周期变化。
我已经做了足够的研究，知道 BRCAPRO 公式太复杂了，无法在我自己的代码中合理地实现。
有一个名为 CancerGene 的知名(癌症医生)软件包:http://www8.utsouthwestern.edu/utsw/cda/dept47829/files/65844.html .这个程序非常古老，在 Windows 95 上运行，包括计算我的客户无法处理的几种癌症形式的引擎。理想情况下，我的客户希望他的应用程序在 Web 上运行，以便他可以轻松地与其他医生共享信息。
我的任务是获取基于 BRCAPRO 引擎构建的 CancerGene 应用程序，并且:
- 复制 90% 的功能
- 删除不必要的功能
- 修改报告的输出
- 如果可能，让它基于网络
现在我的问题:
有人知道如何针对 BRCAPRO 进行编码吗？我用 Google 搜索了两天，没有找到任何 API 文档或开发信息。维基百科上说 BayesMendel 建模软件是用 R 写的，但我不知道 BRCAPRO 是用什么写的。我对 R 完全一无所知。
明确地说，我不需要修改 BRCAPRO 的行为或计算引擎。我只需要知道如何向它提供输入，以便它返回数字给我。
-- 编辑以添加更多信息--
我在上面的链接中下载了 CancerGene 应用程序并安装了它。有少量文档，包括 BRCAPRO 希望收到的数据格式。在不涉及不必要的细节的情况下，BRCAPRO 期望矩阵格式的数据，其中每一列代表一个遗传特征，每一行代表一个家庭成员。现在我只需要知道如何在我从我的 Web/Windows 表单中收集该矩阵后将其传递给 BRCAPRO 引擎。
希望 Stack Overflow 上有几位医生/开发人员!
KN
最佳答案
根据 this link :
The BRCAPRO model is now included in the R package BayesMendel for carrier probabiity [sic] prediction.
所以看起来你在 R 中使用它。
还有 documentation for the BayesMendel package 至少可以让你开始。尽管看起来您将不得不学习 R。:)
关于r - 为 BRCAPRO 癌症基因风险计算引擎编写 GUI，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/551113/