我有两个数据框(tibbles),每个数据框有 2 个变量:
请注意 data 是一个列表变量,使用 tidyr 包的 nest() 函数创建。
library(tidyverse)
library(lubridate)
# negative tests
dates.neg <- ymd(c('2018-02-01', '2018-02-06', '2018-02-10',
'2018-02-21', '2018-04-05'))
df.NEG <- tibble(ID = paste0('ID_', rep(1, 5)),
DATE = dates.neg) %>%
group_by(ID) %>%
nest()
df.NEG
## # A tibble: 1 x 2
## ID data
## <chr> <list>
## 1 ID_1 <tibble [5 × 1]>
dates.pos <- ymd(c('2018-02-07', '2018-02-12', '2018-02-13',
'2018-02-20', '2018-02-21', '2018-03-18'))
df.POS <- tibble(ID = paste0('ID_', rep(1, 6)),
DATE = dates.pos)
df.POS
## # A tibble: 6 x 2
## ID DATE
## <chr> <date>
## 1 ID_1 2018-02-07
## 2 ID_1 2018-02-12
## 3 ID_1 2018-02-13
## 4 ID_1 2018-02-20
## 5 ID_1 2018-02-21
## 6 ID_1 2018-03-18
我想知道在阳性测试结果后最多 2 天内,哪些阳性测试也有阴性测试。我试过使用 purrr 包的 map2() 函数
df.TOTAL <- df.POS %>%
left_join(df.NEG, by = 'ID') %>%
mutate(TIME = interval(DATE, DATE + days(2)),
RESULT = map2(data, "DATE", TIME, ~ .x %within% .y))
不幸的是,我的代码不起作用。 RESULT 变量应该是逻辑的,如果在阳性测试后最多 2 天出现阴性测试结果,则返回 TRUE。相反,它是一个列表并返回 NULL。
df.TOTAL
## # A tibble: 6 x 5
## ID DATE data TIME RESULT
## <chr> <date> <list> <S4: Interval> <list>
## 1 ID_1 2018-02-07 <tibble [5 × 1]> 2018-02-07 UTC--2018-02-09 UTC <NULL>
## 2 ID_1 2018-02-12 <tibble [5 × 1]> 2018-02-12 UTC--2018-02-14 UTC <NULL>
## 3 ID_1 2018-02-13 <tibble [5 × 1]> 2018-02-13 UTC--2018-02-15 UTC <NULL>
## 4 ID_1 2018-02-20 <tibble [5 × 1]> 2018-02-20 UTC--2018-02-22 UTC <NULL>
## 5 ID_1 2018-02-21 <tibble [5 × 1]> 2018-02-21 UTC--2018-02-23 UTC <NULL>
## 6 ID_1 2018-03-18 <tibble [5 × 1]> 2018-03-18 UTC--2018-03-20 UTC <NULL>
任何人都可以帮忙吗?
我会很感激一些帮助。首先十分感谢!
最佳答案
首先,请注意,您可以测试“负”日期向量中的任何元素是否落在“正”区间内,如下所示:
any(dates.neg %within% interval(dates.pos[1], dates.pos[1] + days(2)))
# [1] FALSE
这建议使用以下方法
map2
-- 或更有用的是,map2_lgl
:df.TOTAL <- df.POS %>%
left_join(df.NEG, by = 'ID') %>%
mutate(TIME = interval(DATE, DATE + days(2)),
RESULT = map2_lgl(data, TIME, ~any(.x$DATE %within% .y)))
# # A tibble: 6 x 5
# ID DATE data TIME RESULT
# <chr> <date> <list> <S4: Interval> <lgl>
# 1 ID_1 2018-02-07 <tibble [5 x 1]> 2018-02-07 UTC--2018-02-09 UTC FALSE
# 2 ID_1 2018-02-12 <tibble [5 x 1]> 2018-02-12 UTC--2018-02-14 UTC FALSE
# 3 ID_1 2018-02-13 <tibble [5 x 1]> 2018-02-13 UTC--2018-02-15 UTC FALSE
# 4 ID_1 2018-02-20 <tibble [5 x 1]> 2018-02-20 UTC--2018-02-22 UTC TRUE
# 5 ID_1 2018-02-21 <tibble [5 x 1]> 2018-02-21 UTC--2018-02-23 UTC TRUE
# 6 ID_1 2018-03-18 <tibble [5 x 1]> 2018-03-18 UTC--2018-03-20 UTC FALSE
感谢@ubutun 改进答案。
关于r - 如何检查日期是否在 R 中的间隔列表内?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/53460597/