我正在使用下面的代码来生成下面的图表。
# Setup
data(airquality)
# Device start
png(filename = "example.png", units = "cm", width = 20, height = 14, res = 300)
# Define chart
pairs.chrt <- ggpairs(airquality,
lower = list(continuous = "smooth"),
diag = list(continuous = "blank"),
upper = list(continuous = "blank")) +
theme(legend.position = "none",
panel.grid.major = element_blank(),
axis.ticks = element_blank(),
axis.title.x = element_text(angle = 180, vjust = 1, color = "black"),
panel.border = element_rect(fill = NA))
# Device off and print
print(pairs.chrt)
dev.off()
我目前正在尝试修改 的显示轴标题 .特别是,我希望轴标题为:
例如,我想获得轴 标题 类似于下图中的那些(我只对轴标签感兴趣,而不是在图表的其余部分):
取自:Geovisualist
我尝试调整我的语法以更改
axis.title.x
到不同的值,但它不会产生预期的结果。例如使用 angle = 45
运行代码.axis.title.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, color = "black"),
panel.border = element_rect(fill = NA))
返回相同的图表。我可以通过更改
axis.text.x
来控制轴标签例如,但我找不到如何控制此图中的轴标题的答案。任何帮助都感激不尽。
最佳答案
简短的回答:似乎没有一种优雅或简单的方法可以做到这一点,但这里有一个解决方法。
我挖了ggpairs
源代码(在 GGally package source available from CRAN 中)查看变量标签的实际绘制方式。 ggpairs.R
中的相关功能是 print.ggpairs
.事实证明,变量标签不是 ggplot
的一部分。绘图矩阵的每个单元格中的对象——即它们不是轴标题,这就是为什么它们不受使用 theme(axis.title.x = element_text(angle = 45)
影响的原因或类似的。
相反,它们似乎是使用 grid.text
绘制为文本注释。 (在包 'grid'
中)。 grid.text
接受参数,包括 x, y, hjust, vjust, rot
(其中 rot
是旋转角度),以及使用 gpar
的字体大小、字体系列等(见 ?grid.text
),但目前似乎没有办法将这些参数的不同值传递给 print.ggpairs
-- 它们固定为默认值。
您可以先将变量标签留空,然后使用修改 print.ggpairs
的相关部分,然后通过自定义放置、旋转和样式添加它们来解决这个问题。代码。我想出了以下修改。 (顺便说一句,因为原始 GGally
源代码是在 GPL-3 license 下发布的,所以这次修改也是如此。)
customize.labels <- function(
plotObj,
varLabels = NULL, #vector of variable labels
titleLabel = NULL, #string for title
leftWidthProportion = 0.2, #if you changed these from default...
bottomHeightProportion = 0.1, #when calling print(plotObj),...
spacingProportion = 0.03, #then change them the same way here so labels will line up with plot matrix.
left.opts = NULL, #see pattern in left.opts.default
bottom.opts = NULL, #see pattern in bottom.opts.default
title.opts = NULL) { #see pattern in title.opts.default
require('grid')
vplayout <- function(x, y) {
viewport(layout.pos.row = x, layout.pos.col = y)
}
numCol <- length(plotObj$columns)
if (is.null(varLabels)) {
varLabels <- colnames(plotObj$data)
#default to using the column names of the data
} else if (length(varLabels) != numCol){
stop('Length of varLabels must be equal to the number of columns')
}
#set defaults for left margin label style
left.opts.default <- list(x=0,
y=0.5,
rot=90,
just=c('centre', 'centre'), #first gives horizontal justification, second gives vertical
gp=list(fontsize=get.gpar('fontsize')))
#set defaults for bottom margin label style
bottom.opts.default <- list(x=0,
y=0.5,
rot=0,
just=c('centre', 'centre'),#first gives horizontal justification, second gives vertical
gp=list(fontsize=get.gpar('fontsize')))
#set defaults for title text style
title.opts.default <- list(x = 0.5,
y = 1,
just = c(.5,1),
gp=list(fontsize=15))
#if opts not provided, go with defaults
if (is.null(left.opts)) {
left.opts <- left.opts.default
} else{
not.given <- names(left.opts.default)[!names(left.opts.default) %in%
names(left.opts)]
if (length(not.given)>0){
left.opts[not.given] <- left.opts.default[not.given]
}
}
if (is.null(bottom.opts)) {
bottom.opts <- bottom.opts.default
} else{
not.given <- names(bottom.opts.default)[!names(bottom.opts.default) %in%
names(bottom.opts)]
if (length(not.given)>0){
bottom.opts[not.given] <- bottom.opts.default[not.given]
}
}
if (is.null(title.opts)) {
title.opts <- title.opts.default
} else{
not.given <- names(title.opts.default)[!names(title.opts.default) %in%
names(title.opts)]
if (length(not.given)>0){
title.opts[not.given] <- title.opts.default[not.given]
}
}
showLabels <- TRUE
viewPortWidths <- c(leftWidthProportion,
1,
rep(c(spacingProportion,1),
numCol - 1))
viewPortHeights <- c(rep(c(1,
spacingProportion),
numCol - 1),
1,
bottomHeightProportion)
viewPortCount <- length(viewPortWidths)
if(!is.null(titleLabel)){
pushViewport(viewport(height = unit(1,"npc") - unit(.4,"lines")))
do.call('grid.text', c(title.opts[names(title.opts)!='gp'],
list(label=titleLabel,
gp=do.call('gpar',
title.opts[['gp']]))))
popViewport()
}
# viewport for Left Names
pushViewport(viewport(width=unit(1, "npc") - unit(2,"lines"),
height=unit(1, "npc") - unit(3, "lines")))
## new for axis spacingProportion
pushViewport(viewport(layout = grid.layout(
viewPortCount, viewPortCount,
widths = viewPortWidths, heights = viewPortHeights
)))
# Left Side
for(i in 1:numCol){
do.call('grid.text',
c(left.opts[names(left.opts)!='gp'],
list(label=varLabels[i],
vp = vplayout(as.numeric(i) * 2 - 1 ,1),
gp=do.call('gpar',
left.opts[['gp']]))))
}
popViewport()# layout
popViewport()# spacing
# viewport for Bottom Names
pushViewport(viewport(width=unit(1, "npc") - unit(3,"lines"),
height=unit(1, "npc") - unit(2, "lines")))
## new for axis spacing
pushViewport(viewport(layout = grid.layout(
viewPortCount, viewPortCount,
widths = viewPortWidths, heights = viewPortHeights)))
# Bottom Side
for(i in 1:numCol){
do.call('grid.text',
c(bottom.opts[names(bottom.opts)!='gp'],
list(label=varLabels[i],
vp = vplayout(2*numCol, 2*i),
gp=do.call('gpar',
bottom.opts[['gp']]))))
}
popViewport() #layout
popViewport() #spacing
}
这是调用该函数的示例:
require('data.table')
require('GGally')
require('grid')
fake.data <- data.table(test.1=rnorm(50), #make some fake data for demonstration
test.2=rnorm(50),
test.3=rnorm(50),
test.4=rnorm(50))
g <- ggpairs(data=fake.data,
columnLabels=rep('', ncol(fake.data)))
#Set columnLabels to a vector of blank column labels
#so that original variable labels will be blank.
print(g)
customize.labels(plotObj=g,
titleLabel = 'Test plot', #string for title
left.opts = list(x=-0.5, #moves farther to the left, away from vertical axis
y=0.5, #centered with respect to vertical axis
just=c('center', 'center'),
rot=90,
gp=list(col='red',
fontface='italic',
fontsize=12)),
bottom.opts = list(x=0.5,
y=0,
rot=45, #angle the text at 45 degrees
just=c('center', 'top'),
gp=list(col='red',
fontface='bold',
fontsize=10)),
title.opts = list(gp=list(col='green',
fontface='bold.italic'))
)
(这会产生一些非常难看的标签——仅用于演示目的!)
我没有修改将标签放置在左侧和底部以外的位置 - 就像在您的 Geovisualist 示例中一样 - 但我认为您可以通过将参数更改为
vplayout
来做到这一点。在 customize.labels
中的“左侧”和“底部”代码段中. x
和 y
grid.text
中的坐标是相对于视口(viewport)定义的,视口(viewport)将显示区域划分为网格pushViewport(viewport(layout = grid.layout(
viewPortCount, viewPortCount,
widths = viewPortWidths, heights = viewPortHeights
)))
调用
vplayout
指定网格的哪个单元格用于定位每个标签。
关于r - 在 ggpairs (GGally) 中操作轴标题,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/28427572/