r - 排除R中的空白和NA

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Possible Duplicate:
R - remove rows with NAs in data.frame

我有一个名为sub.new的数据框，其中有多个列。我正在尝试排除任何包含NA或blank space“”的单元格。
我尝试使用subset()，但它的目标条件是特定的列。无论如何，有没有要扫描整个数据帧并创建一个子集，该子集的任何单元格都不是NA或blank space？

在下面的示例中，仅保留第一行:

# ID               SNP             ILMN_Strand   Customer_Strand
ID1234              [A/G]          TOP           BOT
Non-Specific        NSB (Bgnd)     Green
Non-Polymorphic     NP (A)         Red
Non-Polymorphic     NP (T)         Purple
Non-Polymorphic     NP (C)         Green
Non-Polymorphic     NP (G)         Blue
Restoration         Restore        Green

有什么建议？谢谢

Answer 1

一个好主意是在进行任何进一步分析之前，将所有“”(空白单元格)设置为NA。

如果您正在从文件中读取输入，则最好将所有“”都强制转换为NA:

foo <- read.table(file="Your_file.txt", na.strings=c("", "NA"), sep="\t") # if your file is tab delimited

如果已经加载了表，则可以执行以下操作:

foo[foo==""] <- NA

然后，仅保留没有NA的行，您可以使用na.omit():

foo <- na.omit(foo)

或保留没有NA的列:

foo <- foo[, colSums(is.na(foo)) == 0]