r - Shiny 应用程序的代码分析？

Question

对于 R Shiny Web 应用程序，有哪些好方法可以运行代码分析，以显示 Shiny 代码中占用最多处理时间的部分？

我有一个又大又肥又复杂的 Shiny 应用程序，我想弄清楚在这个迷宫般的代码中，我的 Shiny 应用程序最慢的地方。我已经尝试过 Rprof 和 profr 但并没有从他们那里得到太多的见解。

Answer 1

我认为这个问题需要一点更新，因此我正在添加另一个答案......

您可以使用包profvis也可以分析 Shiny 的应用程序。它将直接为您的 R 代码提供火焰图。 IE。无需使用 Chrome 的火焰图来猜测瓶颈在哪里。您将确切地知道在哪里更改您的代码。

操作方法如下:

通过 Profvis

运行 Shiny 的应用程序

与 Shiny 的应用程序互动

关闭浏览器

通过停止按钮停止控制台

加载配置文件

如果第 5 步失败，请尝试以下操作:如果需要，转换为 html(内存问题)

下面添加了某些步骤的详细信息:

第 1 步:运行 profvis

library(profvis)
profvis({ runApp('directory_of_shiny_app') }  
    , prof_output = '/directory_to_save_profile')

第 5 步:加载您的个人资料

profvis(prof_input = '/path_to_save_output/random_name.Rprof') 

注: Profvis 为您的文件随机命名。所以你需要相应地改变输入路径

第六步:转成html

如果您有一个巨大的应用程序并且火焰图变得更长一点，则可能需要此步骤。您可能会收到错误“Pandoc:... memory”

p <- profvis(prof_input = '/path_to_save_output/file108f93bff877b.Rprof')
htmlwidgets::saveWidget(p, "/path_to_save_output/profile.html")

然后在浏览器中打开 html 文件。