r - 如何在 R 中有效转置矩阵？

Question

我有一个大矩阵，我想对其进行转置，而不必将其放入内存中。我可以想到三种方法来实现这一目标:

1. 将原始矩阵逐列写入 .txt 文件。随后，使用readLines(...)将其逐行读入内存，并按顺序将这些行写入新文件。这种方法的问题是我不知道如何按列而不是按行附加到 .txt 文件。
2. 从 .txt 文件中逐列读取矩阵，然后逐行将这些列写入新文件。我已使用 scan(pipe("cut -f1 filename.txt")) 尝试过此操作，但此操作在每次迭代时都会打开一个单独的连接，因此由于相关的开销，需要很长时间才能完成打开和关闭这些连接。
3. 使用一些未知的 R 函数来完成任务。

我在这里缺少什么吗？我需要使用单独的程序来执行此操作吗？预先感谢您的帮助!

Answer 1

有很多语言在这类事情上做得更好。如果您确实想使用 R，则必须一次读取一行文件，从所需的列中取出一个元素，将其存储在向量中，然后将该向量写入一行。并对每一列执行此操作。

Columns = 1e9
Rows = 1e6

FileName = "YourFile.csv"
NewFile = "NewFileName"

for(i in 1:Columns)
{
    ColumnToBeRow = vector("numeric", Columns)
    for(j in 1:Rows)
    {
        ColumnToBeRow[j] = read.csv(FileName, nrows=1, skip=(j - 1), header=F)
    }
    write.csv(ColumnToBeRow, NewFile, append=TRUE)
}