r - 如何使用 R 读取位于 Linux 服务器上的文件

Question

我有一个 CSV 文件，我想对其进行处理，我已尝试使用此代码来读取它

d = read.table( pipe( 'ssh don@140.184.134.189 "cat cluster.csv"' ), header = T )

但我没有得到任何结果并收到此消息:

“读取表格时出错”

没有询问我的密码。

另外，如何运行位于同一服务器上的 R 脚本 fes.r？

Answer 1

您可以先尝试此操作，然后按照您所在的路线继续:

> d <- read.table(pipe('ssh -l don 140.184.134.189 "cat cluster.csv"'))
don@140.184.134.189 password: # type password here

如果您没有收到输入密码的提示，则您的 ssh 可能存在配置问题。请注意，ssh 必须安装在您的 $PATH 中(这意味着 R 可以从任何运行的地方调用它)。

如果此选项不起作用，那么您可以尝试使用 RCurl 包中的 scp。

尝试以下操作:

x = scp("140.184.134.189", "cluster.csv", "PASSPHRASE", user="don")

此处您应该将“PASSPHRASE”替换为本地 SSH key 的密码。

另一件事是要检查“cluster.csv”是否确实是远程服务器上文件的正确路径。但看来您还没有走到这一步，所以先解决 ssh 问题。

向this致敬Stack Overflow 帖子以获取灵感。