如何使用 github 和 Dockerfile 添加 R 包的安装说明。
R环境中常用的命令是:
devtools::install_github("smach/rmiscutils")
但到目前为止还没有成功。尝试将 github 存储库添加到安装说明中:
RUN install2.r --error \
-r 'http://cran.rstudio.com' \
-r 'http://github.com/smach/rmiscutils'
但是我收到一个错误:
error in download. Status was '404 Not found'
也许使用普通的 R 调用,但无法计算命令。 有什么提示吗?
最佳答案
试试这个:
RUN installGithub.r smach/rmiscutils \
&& rm -rf /tmp/downloaded_packages/
一个好的做法是删除所有下载的包以减小图像大小。
这里添加了从 Bioconductor 安装时的命令(以防有人在这里结束寻求帮助)
RUN install2.r -r http://bioconductor.org/packages/3.0/bioc --deps TRUE \
phyloseq \
&& rm -rf /tmp/downloaded_packages/
关于r - 在 Dockerfile 中添加用于从 Github 安装的 R 包,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/43160316/