r - R CRAN 检查中的注释 ---没有存储库集,因此跳过了循环依赖检查

标签 r package cran

我已阅读NOTE in R CRAN Check: No repository set, so cyclic dependency check skipped据我所知,遵循了这些建议。具体来说,我有一个 .Rprofile文件在 ~/线路 options(repos = c(CRAN=\"http://cran.r-project.org\") 。我在页面底部运行了 bash 脚本,但仍然有两个注释,而不是我期望的关于新提交的注释。

bash-3.2$ ${R} CMD check --as-cran ${name}
* using log directory ‘/private/tmp/deptest.Rcheck’
* using R version 3.1.2 (2014-10-31)
* using platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
* using session charset: UTF-8
* checking for file ‘deptest/DESCRIPTION’ ... OK
* checking extension type ... Package
* this is package ‘deptest’ version ‘1.0’
* checking CRAN incoming feasibility ... NOTE
Maintainer: ‘John Doe <jdoe@doe.net>’
New submission
* checking package namespace information ... OK
* checking package dependencies ... NOTE
  No repository set, so cyclic dependency check skipped
* checking if this is a source package ... OK

关于如何消除有关No repository set, so cyclic dependency check skipped的第二个注释的任何建议运行时R CMD check --as-cran将是最受欢迎的。当我尝试创建一个更大的包时,我也得到了同样的两个注释。当我尝试使用 RStudio 作为编辑器来构建一个包时,会出现相同的两个注释。

> sessionInfo()
R version 3.1.2 (2014-10-31)
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.1.2

验证.Rprofile的内容我输入:

ip-152010130116:~ alan$ pwd
/Users/alan
ip-152010130116:~ alan$ open -a TextEdit .Rprofile

以及 .Rprofile 中的单行是

options(repos = c(CRAN = "http://cran.r-project.org"))

提前致谢

CRAN 接受带有 NOTE No repository set, so cyclic dependency check skipped 的包裹的可能性有多大? ?

最佳答案

我也遇到了你的问题,并通过将以下内容添加到 .Rprofile 来修复它:

 local({r <- getOption("repos"); r["CRAN"] <- "http://ftp.ussg.iu.edu/CRAN/";   options(repos = r)})

我认为你的问题是因为你没有指向特定的 CRAN 镜像。 您将需要更改存储库以反射(reflect)距离您最近的镜像。

关于r - R CRAN 检查中的注释 ---没有存储库集,因此跳过了循环依赖检查,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/27046546/

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