r - iGraph 创建子图

Question

我有以下问题:
我有以下图表:g6其中不包括isolate vertices 。顶点主要分为两个ethnic groups ，作为属性给出，即:mestizo and saraguro .
所以我运行 subgraph saraguros 的选项如下:

g2saraguro <- subgraph(g6, which(V(g6)$ethnic=="saraguro"))
summary(g2saraguro)

确实有效:

Vertices: 166
Edges: 330
Directed: TRUE
No graph attributes.
Vertex attributes: ii, village, parroquia, canton, provinz, kindR, ethnic, situation, researcha.
Edge attributes: question, activity.

但是，如果我尝试使用 mestizo 进行同样的操作，有一个问题，因为它只是识别:

s2mestizo <- subgraph(g6,V(g6)$ethnic=="mestizo")
summary(s2mestizo)
Vertices: 2
Edges: 3
Directed: TRUE
No graph attributes.
Vertex attributes: ii, village, parroquia, canton, provinz, kindR, ethnic, situation, researcha.
Edge attributes: question, activity.

但实际上情况并非如此，如果我看到:V(g6)$ethnic , mestizo是大多数!!
我真不知道问题出在哪里，用igraph 0.6形成 subgraph 的程序应该以这种方式或类似的方式，没有 1-based indexing .
非常感谢您的帮助
问候
弗拉基米尔

Answer 1

在第二种情况下你忘记使用which函数；即，而不是

s2mestizo <- subgraph(g6,V(g6)$ethnic=="mestizo")

你应该写

s2mestizo <- subgraph(g6, which(V(g6)$ethnic=="mestizo"))

另请注意，如果您使用 igraph 0.5.x 或更早版本，则必须从 which 的结果中减去 1，因为 igraph 的索引基于 0。此问题已在 igraph 0.6 中修复，因此如果您使用 igraph 0.6 或更高版本，则无需减去 1。

编辑:根据您最近的评论，您似乎使用的是 igraph 0.5.x 或更早版本(因为 summary 的输出格式与 0.6 不同)。在这种情况下，您必须从which的结果中减去1，因为igraph 0.5.x及更早版本使用从零开始的顶点索引。因此，正确的行应该是:

s2mestizo <- subgraph(g6, which(V(g6)$ethnic=="mestizo")-1)