r - 比较两个列表 [R]

Question

我有两个相当长的列表(都是 232000 行)。当尝试使用两者运行分析时，R 给我一个错误，一个列表中的某些元素不在另一个列表中(对于要运行的特定代码，两个列表需要完全相同)。我已完成以下操作来尝试破译这一点:

#In Both
both <- varss %in% varsg
length(both)

#What is in Both
int <- intersect(varss,varsg)
length(int)

#What is different in varss
difs <- setdiff(varss,varsg)
length(difs)

#What is different in varsg
difg <- setdiff(varsg,varss)
length(difg)

我认为我的代码是正确的，但我的问题是上面代码的结果没有产生我需要的结果。例如，对于 both <- varss %in% varsg我只得到一个FALSE 。我的两个列表是否都需要属于特定类别才能正常工作？我试过data.frame , list和character 。不确定是否有像 function 这样的重大事件需要申请。

只是为了提供有关我的列表的更多信息，两者都是 SNP 名称(遗传数据)列表

编辑:

我已将这两个文件加载为 readRDS()不确定这是否会导致一些问题。当尝试仅使用 varss[1:10,] 时我得到以下信息:

 [1] rs41531144 rs41323649 exm2263307 rs41528348 exm2216184 rs3901846 
 [7] exm2216185 exm2216186 exm2216191 exm2216198
232334 Levels: exm1000006 exm1000025 exm1000032 exm1000038 ... rs9990343

我对 RData 的经验很少文件，所以不确定这是否是一个问题...

使用 varsg[1:10,] 也会发生同样的情况:

 [1] exm2268640 exm41      exm1916089 exm44      exm46      exm47     
 [7] exm51      exm53      exm55      exm56     
232334 Levels: exm1000006 exm1000025 exm1000032 exm1000038 ... rs999943 

Answer 1

您展示的所有功能都不能很好地与列表或 data.frames 配合使用，例如:

varss <- list(a = 1:8)
varsg <- list(a = 2:9)

both <- varss %in% varsg
both
# [1] FALSE

#What is in Both
int <- intersect(varss,varsg)
int
# list()

#What is different in varss
difs <- setdiff(varss,varsg)
difs
# [[1]]
# [1] 1 2 3 4 5 6 7 8

#What is different in varsg
difg <- setdiff(varsg,varss)
difg
# [[1]]
# [1] 2 3 4 5 6 7 8 9

我建议您通过以下方式切换到向量:

varss <- unlist(varss)
varsg <- unlist(varsg)