r - 在 R 中保存高分辨率图像

Question

我正在 R(R 版本 3.2.1)中使用 ggplot 创建散点图。我想将图形保存为 300 DPI 的 tiff 图像，以便在期刊上发布。但是，我的代码使用 ggsave 或 tiff() 与 dev.off 似乎不起作用，并且仅将其保存为 96 DPI。任何帮助将不胜感激!!下面是我使用这两种方法的代码示例:

library(ggplot2)

x <- 1:100
y <- 1:100

ddata <- data.frame(x,y)

library(ggplot2)

#using ggsave
ggplot(aes(x, y), data = ddata) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method=lm, fill = NA, fullrange=TRUE, color = "black")

ggsave("test.tiff", units="in", width=5, height=4, dpi=300, compression = 'lzw')

#using tiff() and dev.off
tiff('test.tiff', units="in", width=5, height=4, res=300, compression = 'lzw')

ggplot(aes(x, y), data = ddata) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method=lm, fill = NA, fullrange=TRUE, color = "black")

dev.off()

输出为 96 DPI，宽度为 1500 像素，高度为 1200 像素。

Answer 1

您可以执行以下操作。在第一行代码后添加 ggplot 代码，并以 dev.off() 结尾。

tiff("test.tiff", units="in", width=5, height=5, res=300)
# insert ggplot code
dev.off()

res=300 指定您需要分辨率为 300 dpi 的图窗。名为“test.tiff”的图形文件保存在your working directory中.

根据所需的输出更改上面代码中的宽度和高度。

请注意，这也适用于其他 R 图，包括 plot、image 和 pheatmap。

其他文件格式

除了 TIFF 之外，您还可以轻松使用other image file formats包括 JPEG、BMP 和 PNG。其中一些格式需要较少的内存来保存。