python - Pypi 和 Cython

Question

我正在尝试组装我的第一个 PyPi 包，但对它的一些基本方面越来越感到困惑。

我的软件包依赖于SNPknock。当我尝试在新系统(Ubuntu 18.04)上安装它时，我得到:

pip install snpknock
Collecting snpknock
  Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/68/a0/ceb6adc2b7f1a3009f2077c157a99640094021a66f881cb678ecf4
78887f/SNPknock-0.5.2.tar.gz
    Complete output from command python setup.py egg_info:
    You don't seem to have Cython installed. Please get a
    copy from www.cython.org and install it

我已经提取了setup.py from the tarball here ，其中包括该错误消息。

这是我的困惑。 setup.py 文件将 Cython 指定为依赖项:

DEPENDENCIES = ['Cython>='+CYTHON_MIN_VERSION,
                'numpy>='+NUMPY_MIN_VERSION]

但是，它也导入了 Cython，但似乎需要这样做才能对某些模块进行 cython 化。这一切看起来有点循环，但我怀疑我(或这个包的作者)错过了这个过程的一些东西。

Answer 1

问题似乎是您的平台没有轮子/鸡蛋。在这种情况下pip下载源并运行 python setup.py install 。如果setup.py进口Cython如果说 Cython 也没关系被列为依赖项。您必须有Cython运行之前pip install因为pip如果不运行 setup.py 则无法从源代码获取依赖项列表和setup.py需要Cython可导入。

如果snpknock我们曾经为您的 Python 版本发布过鸡蛋或轮子 pip会下载它，获取依赖项列表并在不咨询的情况下安装它们 setup.py ;之后它会安装该软件包。在这种情况下pip会自动下载Cython或者直接从 Egg​​/wheel 安装编译的扩展。