R包 'biomod2'执行plot函数时找不到文件

Question

我正在尝试使用 biomod2 包中的 plot() 函数，遵循此处的小插图 ( http://finzi.psych.upenn.edu/usr/share/doc/library/biomod2/doc/Simple_species_modelling.pdf )。以下是我收到的错误:

getwd() 
# [1] "/home/gjanzen/Documents/Hufford/Drought/Data/Layers"
plot(myBiomodData) 

Error in getExportedValue(pkg, name) : cannot open file '~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/viridisLite/data/Rdata.rdb': No such file or directory In addition: Warning message: In getExportedValue(pkg, name) : restarting interrupted promise evaluation

我已确认 Rdata.rdb 存在，位于以下目录中:

f <- file.choose()
f 
# [1] "/home/gjanzen/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/viridisLite/data/Rdata.rdb"

所以，对我来说，似乎 plot() 函数找错了地方。如何更改此函数查找 Rdata.rdb 的位置？我可以以某种方式改变路径吗？或者更改我的工作目录可以解决这个问题吗？

PS - 这是我在 Stack Overflow 上的第一篇文章，因此请原谅任何礼仪错误，和/或随时向我指出这些错误，以便我不再重复。

Answer 1

我认为首先要尝试的是重新安装似乎是造成问题的软件包viridisLite。

install.packages('viridisLite', dep = TRUE)

如果这不能解决问题，您应该尝试打开一个新的绘图设备抛出 x11() 以检查问题是否不是来自 R(或 RStudio)绘图设备本身。