java - 使用 rJava 从 R 中使用 Jackcess

Question

我不太熟悉Java，但我尝试在R(我最喜欢的)中完成这项任务!

有一个名为 Jackcess 的 Java 库。 。我想连接到该库并打开其中的 MS Access 2003 .mdb 文件。 Jackcess cookbook告诉我使用这个库的第一步是这样的:

Database db = DatabaseBuilder.open(new File("mydb.mdb"));

或者正如@Gord建议的那样，

File file = new File("C:/Users/Public/jackcessTest.mdb");
DatabaseBuilder dbbo = new DatabaseBuilder();
dbbo.setFile(file);
Database db = dbbo.open();

但我被困在这第一步。

我已经安装了 Java 和 rJava 并设置了有关目录的所有内容。 这是我在 R

中的代码

library(rJava)

.jinit()
.jaddClassPath("java/jackcess-2.1.2.jar") # there I have put the downloaded jar file of Jackcess

# .jaddClassPath("java/commons-logging-1.2.jar") # this is the commons-logging class that Jackcess depends on, commented to replicate problem 2] in my question.



file.name <- "D:/63.mdb" # some data base .mdb file (containing only tables)

file <- .jnew("java/io/File",file.name)
dbbo <- .jnew("com/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder")

[编辑:我发现我有两个问题，一个已解决，一个仍然没有。] 到目前为止，一切都很好，但从现在开始我遇到了一些问题:

1] 在没有签名不匹配的情况下正确调用 Jackcess 的方法，这些都不起作用:

dbbo <- .jcall(dbbo,"L<DatabaseBuilder>","setFile",file)
dbbo <- .jcall(dbbo,"Lcom/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder","setFile",file)

我收到此错误:

Error in .jcall(dbbo, "Lcom/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder",  : 
method setFile with signature (Ljava/io/File;)Lcom/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder not found

我找到了这一步的答案，我只需要在类定义字符串末尾有一个分号(;)。

dbbo <- .jcall(dbbo,"Lcom/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder;","setFile",file)

2]正确调用open方法，我的第一轮尝试:

 db <- .jcall(dbbo,"Lcom/healthmarketscience/jackcess/Database;","open",evalArray = FALSE,evalString = FALSE)

我收到此错误:

 Error in .jcall(dbbo, "Lcom/healthmarketscience/jackcess/Database;", "open",  : 
 java.lang.NoClassDefFoundError: org/apache/commons/logging/LogFactory

我用谷歌搜索发现 Jackcess 依赖于一些名为 commons-logging 的库，因此下载并将其添加到类路径中可以解决该问题

3] 正确调用 open 方法，我的第二轮尝试:在类路径中使用 commons-logging

db <- .jcall(dbbo,"Lcom/healthmarketscience/jackcess/Database;","open",evalArray = FALSE,evalString = FALSE)

这给了我这个错误:

Error in .jcall(dbbo, "Lcom/healthmarketscience/jackcess/Database;", "open",  : 
java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class com.healthmarketscience.jackcess.impl.DatabaseImpl

对这个错误有什么想法吗？

[注意]:在我编辑之前就建议了一些答案，因此它们现在看起来可能无关紧要，但我已在上面解释的步骤中使用了它们。

Answer 1

以下代码显示了 Java 中使用“真实”DatabaseBuilder 对象的 .setFile 和 .open 方法的替代方法:

File file = new File("C:/Users/Public/jackcessTest.mdb");
DatabaseBuilder dbbo = new DatabaseBuilder();
dbbo.setFile(file);
Database db = dbbo.open();

在 rJava 中尝试类似的操作，看看它是否适合您。

编辑回复:更新的问题

您提到您添加了 Apache commons-logging到您的 CLASSPATH，但 Jackcess 还依赖于 Apache commons-lang v2.x(不是 v3.x)，因此请尝试下载它并将其也包含在您的 CLASSPATH 中。