linux - Linux 中的 runjags 摘要

Question

我设置summarise = TRUE在函数 run.jags 中，然后将输出对象保存为 save(out, file="out.RData") .

当我稍后加载该对象时，我可以检索摘要、图表等。

但是，当我使用完全相同的代码并运行模型，并将输出保存在 Linux 集群上，然后在 Windows 中加载对象以使用它时，摘要和图表不可用。当我输入summary(out)时, print(out) , plot(out) ，或add.summaries(out) ，我收到以下错误消息:

Error: Invalid runjags.object provided; the output of a runjags function (with class 'runjags') must be supplied

尽管 class(out)返回"runjags" .

事实上，names(out)显示摘要(以及许多其他内容)未包含在输出中。帮助文件确实表明默认情况下包含摘要/图表等。

在 Linux 中运行模型是否会导致 1) 阻止生成摘要，或 2) 弄乱输出对象的类？

我当然可以使用 coda 包并执行 out2 <- as.mcmc.list(out) ，然后我可以使用 coda 函数来处理输出。

Answer 1

问题不是 Linux(请参阅 Matt Denwood 的评论)，而是旧版本的 runjags。我在 Linux 计算机上更新了 runjags(好吧，我让系统管理员执行此操作)，这解决了问题。