python - 如何使内循环考虑外循环的每次迭代？

Question

三字母组，由 'A', 'U', 'G' or 'C' 组成，被定义为密码子。每个密码子对应 20 个字母中的一个。这些字母(氨基酸)的集合被定义为蛋白质。文件“codons.txt”包含密码子和相应的字母。

接下来的问题是:内部 for 循环仅工作一次 - 它仅将 txt 文件中的行与第一个密码子进行比较。然后，据我了解，该方法会跳过内部循环。

代码:

path = r'C:\Users\...\codons.txt'
f = open(path, 'r')

def prot(DNA):
    protein = ''
    a = True
    for i in range (0, len(DNA)-2,3):
        codon = DNA[i:i+3:1]
        print(codon)
        for line in f:
            if line[0:3:1] == codon:
                protein += line[4:5:1]
                print(protein)
    return protein


prot('AGUCAGGAUAGUCUUA')

输出:

 AGU
 S
 CAG
 GAU
 AGU
 CUU

接下来的问题是:如何使内循环对每个密码子起作用？

Answer 1

迭代文件时(for line in f:)，到达文件末尾时停止。

您可以:

• 使用 f.seek(0) 将文件读取器位置重置为文件开头

• 或更改循环的顺序，以便仅在文件上迭代一次。

  def prot(DNA):
      protein = ''
  
      with open(path, 'r') as f:
          for line in f:
              for i in range (0, len(DNA)-2,3):
                  codon = DNA[i:i+3:1]
                  print(codon)
  
                      if line[0:3:1] == codon:
                          protein += line[4:5:1]
                          print(protein)
  
      return protein