python - 在Qt4上安装MayaVi会导致段错误

Question

我正在尝试在计算机上安装MayaVi。我正在使用OS X 10.6.8、4 GB RAM的MacBook Air。

我的python和我的大部分堆栈都是通过Homebrew或pip构建的。特别是对于python2.7，ipython，Qt4，numpy，scipy，vtk等是正确的。VTK在Homebrew中安装了--python和--qt-extern标志，并且所有构建都很好。我没有安装wxPython，因为无法通过pip，手动构建或二进制文件使它工作。

如果我运行ipython -q4thread，由于收到与使用两种不同的PyQt API有关的错误，我将无法成功执行from mayavi import mlab：http://groups.google.com/group/spyderlib/browse_thread/thread/36a35baec74ca144

但是，如果单独运行ipython，则可以成功运行from mayavi import mlab。然后，我尝试遵循以下示例：http://github.enthought.com/mayavi/mayavi/example_using_with_scipy.html，其中包括以下命令：

import numpy as np

def V(x, y, z):
    """ A 3D sinusoidal lattice with a parabolic confinement. """
    return np.cos(10*x) + np.cos(10*y) + np.cos(10*z) + 2*(x**2 + y**2 + z**2)

X, Y, Z = np.mgrid[-2:2:100j, -2:2:100j, -2:2:100j]

from mayavi import mlab
mlab.contour3d(X, Y, Z, V)

一切正常，我弹出了一个窗口，可以旋转3d图等。但是，然后单击图标打开管道，这将打开另一个窗口。然后，该教程说，双击“等值面”以更改其属性。一旦这样做，我就会得到可重现的细分错误。

我不知道如何开始找出问题所在。

或者，我可以从以下命令行运行MayaVi：mayavi2，然后会弹出GUI。当我这样做时，我得到以下输出：

Warning: Unable to import the wx backend for pyface due to traceback: Traceback (most recent call last):
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/toolkit.py", line 45, in _init_toolkit
        be = import_toolkit(tk)
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/toolkit.py", line 31, in import_toolkit
        __import__(be + 'init')
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/ui/wx/init.py", line 14, in <module>
        import wx
    ImportError: No module named wx

尽管GUI确实会弹出，但是如果我尝试执行任何操作，都会遇到段错误。

如果您对解决此问题有任何想法，或者对成功重新安装软件包有任何指导，请告诉我。

谢谢！

乌里

Answer 1

我也有配备OS X 10.7.4（Lion）的MacBook Air。我在二月份花了很多时间让mayavi工作，最终成功达到了可以制作科学图的地步。这仍然意味着某些示例和测试将无法正确运行，并且GUI在控制台中产生了许多错误消息，但是并没有崩溃（大多数时间）。现在，我设法中断了我的Python安装（可能是通过升级numpy进行的），因此我需要重新安装。 6，六个月后并没有变得更容易！

仍然没有可行的预编译选项。我从以下位置尝试了Enthought Python发行版：http://www.enthought.com/repo/.epd_academic_installers。仍然没有Mac版ETS的64位版本，组件是古老的，基于wxPython的mayavi看起来很丑陋，并且感觉很慢且没有响应。回到brew和pip。经过大量的反复试验，这或多或少地起作用了：

1.先决条件

隐藏/卸载损坏的Homebrew Python安装：

mv /usr/local/lib/python2.7/site-packages /usr/local/lib/python2.7/site-packages-old 
mv /usr/local/share/python /usr/local/share/python-old
brew uninstall python pyqt pyside vtk

在Xcode（4.4.1）中，选择llvm-gcc作为编译器（使用clang的成功较少）：

cd /usr/bin
sudo rm cc c++
sudo ln -s gcc cc
sudo ln -s g++ c++

2.安装

2.1 Python

brew install python --framework --universal

指向新安装：

cd /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions
rm Current
ln -s /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/Current .

如果安装了EPD，则需要在/Library/Frameworks/Python.framework/Versions中执行相同的操作，否则EPD将具有优先权。

2.2脾气暴躁

从源代码安装numpy（pip 1.2当前无法正确安装npymath.ini，这将使scipy无法构建）：

git clone https://github.com/numpy/numpy.git
cd numpy
git checkout v1.6.2
python setup.py install

由于有许多软件包与numpy链接，所以我真的建议您查看一个正式版本，即1.6.2。接下来，使numpy标头可见：

cd /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7
ln -s /usr/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include/numpy .

2.3 qt，pyqt，vtk

安装qt（4.8.2）和pyqt（4.9.4）：

brew install qt
brew install pyqt

一个人也可以安装pyside（1.1.1）

brew install pyside

但这似乎会使mayavi崩溃更多。无论如何，请附加

export QT_API=pyqt

.bashrc以避免任何混淆。下次安装vtk（5.10.0； 5.8.0也可以）

brew install vtk --python --tcl --examples --qt

...然后等待（编译大约需要40分钟）。 --qt标志不是严格必需的，但是也没有害处。

接下来，从http://www.vtk.org/files/release/5.10/vtkdata-5.10.0.tar.gz下载vtk数据，将其解压缩到某个位置，并使VTK_DATA_ROOT环境变量指向VTKData目录。在运行一些例子

/usr/local/share/vtk/Examples

使用python <example>.py启动python示例，使用vtk <example.tcl>启动TCL示例。绝对漂亮，对不对？那么，让我们看看mayavi接下来如何将所有事情弄糟...

2.4 ETS和mayavi

虽然

pip install mayavi

将您带到某个地方，它似乎比安装github上的最新漏洞产生更多的崩溃。获取https://github.com/enthought/ets/raw/master/ets.py并运行

python ets.py clone

克隆ETS git存储库。如果要从命令行运行apptools，则只需要mayavi，pyface，traits，traitsui和envisage，可能只需要mayavi2。因此，删除其他目录并执行

python ets.py develop

这应该允许您通过运行mayavi/examples/tvtk来运行mayavi/examples/mayavi和python <example>.py的存储库中的一些示例，并使用GUI。有许多控制台错误和许多不起作用的GUI功能，例如选择LUT表。但是希望它不会崩溃。

2.5 scipy，matplotlib，ipython

我更喜欢从github获取最新消息，以获取scipy和matplotlib。首先使用brew安装所有依赖项。然后

git clone https://github.com/scipy/scipy.git
cd scipy
python setup.py install

git clone https://github.com/matplotlib/matplotlib.git
cd matplotlib
python setup.py install

然后使用pip安装ipython（0.13）。对于qtconsole，请先安装：

pip install pygments
pip install pyzmq

然后

pip install ipython

有几种可能的方法可以启动ipython以便与mayavi一起使用，具体取决于谁控制QT事件循环：


没有ipython的mlab.show()：挂起。
ipython和mlab.show()：有效，但是提示可能没有响应。
ipython --gui=qt或ipython --pylab=qt：有效，但是“保存”对话框立即关闭。
没有ipython qtconsole的mlab.show()：挂起。
ipython qtconsole与mlab.show()：有效。
ipython qtconsole --gui=qt或ipython qtconsole --pylab=qt：有效。


祝好运！