我有两个 DataFrame，我想首先在 dataFrame1 中的 col1 中查找与 DataFrame2 中的 col1 中的匹配值，并打印出 DataFrame1 中的所有列以及 DataFrame2 中的附加列。 例如
我尝试过以下操作，
data = 'file_1'
Up = pd.DataFrame.from_csv(data, sep='\t')
Up = Up.reset_index(drop=False)
Up.head()
Gene_id baseMean log2FoldChange lfcSE stat pvalue padj
0 ENSG.16 176.275036 0.9475260059 0.4310373793 2.1982455617 0.0279316115 0.198658
1 ENSG.10 80.199435 0.4349592748 0.2691551416 1.6160169639 0.1060906455 0.369578
2 ENSG.15 1649.400749 -0.0215428237 0.1285061198 -0.1676404495 0.8668661474 0.947548
3 ENSG.10 25507.767530 0.5145516695 0.2473335499 2.0803957642 0.0374892475 0.229378
4 ENSG.12 70.122885 -0.2612483888 0.2593848667 -1.00718439
第二个数据框是，
mydata = 'file_2'
annon = pd.DataFrame.from_csv(mydata, sep='\t')
annon = annon.reset_index(drop=False)
annon.head()
Gene_id sam_1 sam2 sam3 sam4 sam5 sam6 sam7 sam8 sam9 sam10 sam11
0 ENSG.16 404 55 33 39 102 43 193 244 600 174 120
1 ENSG.10 58 89 110 69 64 48 61 81 98 75 119
2 ENSG.15 1536 1246 2540 1751 1850 2137 1460 1362 2158 1367 1320
3 ENSG.10 28508 23073 19982 13821 20355 28835 26875 25632 27131 30991 29351
4 ENSG.12 87 81 121 67 98 47 37 59 68 44 81
以下是我迄今为止尝试过的，
x=pd.merge(Up[['Gene_id' , 'log2FoldChange ', 'pvalue ' , 'padj']] , annon , on = 'Gene_id')
x.head() Gene_id log2FoldChange pvalue padj sam_1 sam2 sam3 sam4 sam5 sam6 sam7 sam8 sam9 sam10 sam11
它只是给我文件头，没有其他任何东西。 因此，我查看了 file1(Up) 的一行值，如下所示， 这就是我得到的
print(Up.loc[Up['Gene_id'] =='ENSG.16'])
Empty DataFrame
Columns: [Gene_id, baseMean , log2FoldChange , lfcSE , stat , pvalue , padj]
Index: []
但事实上它不是空的，它在数据帧 Up 中有值。
任何解决方案都会很棒..!!!
最佳答案
pd.merge(df1[['Gene_Id' , 'log2FoldChange', 'pvalue' , 'padj']] , df2 , left_on='Gene_Id' , right_on= 'Gene_id')
如果需要，您可以轻松删除 Gene_id
关于python - 如果列中存在匹配值，则使用另一个数据帧注释一个数据帧，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/33826611/