python - Pandas read_csv() - Flie 包含不同的数据

Question

问题: 我正在尝试将 csv 读入包含不同列大小的数据的 pandas 数据帧。

示例和说明:

Code: 
df = pd.read_csv(input, error_bad_lines=False)

input:
ID, Time, Val
15, 18:00:01, 4
15, 18:00:02, 6
15, 18:00:03, 5
ID, Time, Val1, Val2
16 18:00:03, 1, 43
ID, Time, Val
15, 18:00:04, 8

并且这种模式在整个文件中持续存在。最初我正在考虑扔掉多余的列，因为 read_csv 选项会抛出错误并且不读取它们，我只是开始忽略它们。然而，我随后在数据框中得到了重复的 header ...为了解决这个问题，我尝试了 drop_duplicates()但发现只有pandas的V0.17才包含 keep=False选项。我最终开始说服自己尝试保留数据。这是我的问题。根据上面的数据集，我希望能够创建两个独特的数据框。您可以假设 ID 始终是唯一的，因此您可以为拥有的不同 ID 数量创建 N 个框架。每个 ID 不会有相同数量的 header 。一旦遇到不同的 ID，就会打印其标题。例如，如果我们点击另一个 ID 16，其标题将在数据之前打印。同样，如果我们点击另一个 ID 15，其标题将在其数据之前打印。

我想也许在开始使用数据帧之前预处理数据，因为这是一个选项。但由于我对 pandas 的功能还很陌生，我希望在我继续编写一些令人讨厌的预处理代码之前，这里的一些人会提出建议:)。我的另一个想法变成了一个问题 - 对于 error_bad_lines，有没有办法将这些行保存到另一个数据帧或其他东西？另外，我告诉 pandas 在 read_csv 中只查找 ID 为 X 的项目，然后对我的所有 ID 执行此操作？我要补充一点，ID 的数量是有限且已知的。

我当前的 pandas 版本是 0.14。

Answer 1

请注意，我更正了示例数据中我认为存在的拼写错误。

• 我使用前瞻正则表达式分割您的数据。我寻找后跟 ID 的换行符。
• 然后解析列表中的每个元素并连接。

<小时/>

from io import StringIO
import pandas as pd
import re

txt = """ID, Time, Val
15, 18:00:01, 4
15, 18:00:02, 6
15, 18:00:03, 5
ID, Time, Val1, Val2
16, 18:00:03, 1, 43
ID, Time, Val
15, 18:00:04, 8"""

def parse(s):
    return pd.read_csv(StringIO(s), skipinitialspace=True)

pd.concat([parse(s) for s in re.split('\n(?=ID)', txt)])

   ID      Time  Val  Val1  Val2
0  15  18:00:01  4.0   NaN   NaN
1  15  18:00:02  6.0   NaN   NaN
2  15  18:00:03  5.0   NaN   NaN
0  16  18:00:03  NaN   1.0  43.0
0  15  18:00:04  8.0   NaN   NaN

<小时/>

以上是使用 OP 提供的示例数据进行的。如果这是在 csv 文件中，解决方案将如下所示

from io import StringIO
import pandas as pd
import re

with open('myfile.csv') as f:
    txt = f.read()

def parse(s):
    return pd.read_csv(StringIO(s), skipinitialspace=True)

pd.concat([parse(s) for s in re.split('\n(?=ID)', txt)])