python - 从 PosixPath、Python 读取 DICOM 对象

Question

我有 20,000 个 PosixPath，每个都指向不同的 .dcm 对象。我需要一一读取 .dcm 对象。这是到目前为止我的代码:

from pathlib import Path
import glob
import dicom
data = Path('/data')
path_to_dcm_objects = list(data.glob('**/*.dcm'))
for i in len(path_to_dcm_objects):
    record = dicom.read_file(path_to_dcm_objects[i])

当我想使用 PosixPath 读取 .dcm 文件时出现错误:

AttributeError: 'PosixPath' object has no attribute 'read'

如有任何帮助，我们将不胜感激。

Answer 1

dicom.read_file() 需要一个打开的文件对象或路径字符串，而不是 Path 实例。如果它不是字符串，它会认为它是一个打开的文件并尝试从中读取。

使用 str(path_object) 将 Path 实例转换为字符串:

for i in len(path_to_dcm_objects):
    record = dicom.read_file(str(path_to_dcm_objects[i]))

将 Path 对象转换为字符串的帮助:

Return the string representation of the path, suitable for passing to system calls.

您还可以使用:

 path_object.as_posix()

这给你一个 Posix 路径:

Return the string representation of the path with forward (/) slashes.

顺便说一句，迭代所有路径的Python方式看起来更像是这样的:

for path_obj in data.glob('**/*.dcm'):
    record = dicom.read_file(str(path_obj))