我在两个不同的目录中有文件,其中包含索引文本的腌制列表,如下所示,以 .out 格式保存:
(lp0 S'TCCTCTTGGAGCACCAGCTAATATTTCATCAGTATTCGCTGAATCTTCGGACATAGTTCA' p1 aS'TTCGGACATAGTTCATTCATATTTATTTGCCCAATACCCGCACGAAGAAGCCTTGCAGAC' p2 as'AGAAGCCTTGCAGACACCGTGGCA' p3 a.
我想要完成的任务是从可疑文本目录中打开一个文件,并将其与源文本目录中的每个文件进行比较,使用 python 的 difflib,打印出一个数字指示它们是否匹配,然后执行与可疑文本目录中的其余文件相同。 (旁注:如果有人知道比较两个索引文本列表的更详细方法,我洗耳恭听,但这远不是优先事项)
我当前的问题是使用 for 循环来完成此任务,它不起作用。我的意思是,我可以循环浏览文件夹,它们可以打印出文件夹名称,但文件本身的内容不会改变。该循环目前仅多次比较每个目录中的一个文件,我不知道如何修复它。
欢迎提出任何建议,如果我的解释足够清楚,请随时提出任何问题。
谢谢。另外,我知道这是一个常见问题,我已尽力查看以前的答案并应用他们使用的内容,但我很难这样做,因为我不太擅长编程。
提前致谢!
F
代码如下:
import string
import pickle
import sys
import glob
import difflib
sourcePath = 'C:\Users\User\Sou2/*.out'
suspectPath = 'C:\Users\User\Susp2/*.out'
list_of_source_files = glob.glob(sourcePath)
list_of_suspect_files = glob.glob(suspectPath)
def get_source_files(list_of_source_files):
for source_file_name in list_of_source_files:
with open(source_file_name) as source_file:
sourceText = pickle.load(source_file)
return sourceText
get_suspect_files(list_of_suspect_files):
for suspect_file_name in list_of_suspect_files:
with open(suspect_file_name) as suspect_file:
suspectText = pickle.load(suspect_file)
return suspectText
def matching(sourceText,suspectText):
matching = difflib.SequenceMatcher(None,sourceText,suspectText)
print matching.ratio()
def main():
for suspectItem in list_of_suspect_files:
suspectText = get_suspect_files(list_of_suspect_files)
print ('----------------SEPERATOR-----------------')
for sourceItem in list_of_source_files:
sourceText = get_source_files(list_of_source_files)
matching(sourceText,suspectText)
main()
当前结果:
----------------SEPERATOR-----------------
0.0
0.0
0.0
----------------SEPERATOR-----------------
0.0
0.0
0.0
----------------SEPERATOR-----------------
0.0
0.0
0.0
----------------SEPERATOR-----------------
0.0
0.0
0.0
对于其中一些来说,这应该是 1.0,因为我故意将匹配的索引文本添加到系统文本中。
最佳答案
您的函数 get_source_files
和 get_suspect_files
每个都包含循环,但在循环的第一次迭代时返回。这就是为什么您的程序只查看每个列表中的第一个文件。
此外,这两个函数中的循环与主函数中的循环重复。在您的主函数中,您永远不会使用循环变量 suspectItem
和 sourceItem
,因此这些循环只是执行相同的操作多次。
可能,您混淆了 yield
和 return
,并以某种方式期望您的函数表现得像生成器。
这样的东西应该有效
def get_text(file_name):
with open(file_name) as file:
return pickle.load(file)
def matching(sourceText,suspectText):
matching = difflib.SequenceMatcher(None,sourceText,suspectText)
print matching.ratio()
def main():
for suspect_file in list_of_suspect_files:
print ('----------------SEPERATOR-----------------')
suspect_text = get_text(suspect_file)
for source_file in list_of_source_files:
source_text = get_text(source_file)
matching(source_text, suspect_text)
main()
请注意,这会在每次迭代中重复加载源文本。如果速度很慢,并且文本不太长而无法放入内存,您可以将所有源文本和可疑文本存储在列表中。
关于Python for循环遍历目录文件,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/23788367/