python - 从python文件中获取字符串

Question

我有一个文本文件，我想根据变量 site 从中提取某个字符串，该变量表示某个字符的位置。我想提取 site 位置前后 20 个字符。 如果 site 的值超过 20，我的代码可以正常工作。但如果 site 之前的字符少于 20 个，则它不会返回任何内容。

例如，我这里有一个字符串，其中 site=5 在本例中为 K。

MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDXYZX

现在我正在尝试提取字符K前后的20个字符。 下面是我的代码；

data=myfile.read()    
str1 = data[site:site+1+20]
temp = data[site-20:site]
final_sequence = temp+str1
print final_sequence

这给了我一个 KGGKGLGKGGAKRHRKVLRDX 的输出。由于找不到 K 之前的 20 个字符，因此它没有打印 K 之前的字符。

正确的应该是MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDX。

这引出了我的问题。如果 K 值下游的字符少于 20 个，如何修改代码以打印 K 之前的所有字符？ 谢谢。

Answer 1

问题是，由于 site-20 为负，Python 认为它是相对于序列末尾的索引，因此切片是空的(因为第一个索引在最后一个索引之后) )。只要确保永远不会低于 0。

data=myfile.read()    
str1 = data[site:site+1+20]
temp = data[max(site-20, 0):site]
final_sequence = temp+str1
print final_sequence

或更短

data=myfile.read()    
final_sequence = data[max(site-20, 0):site+1+20]
print final_sequence

请注意，您不需要使用 min(site+1+20, len(data)) 作为上限，因为 Python 会自动将超出序列末尾的切片索引剪切到序列中长度。