python - 根据列的数字内容从制表符分隔的文件中删除列？

Question

我有一个制表符分隔的文件，如下所示: 第一列包含位置编号，1-end 其余的都有一些频率数字。

Position     A    B    C    D
1          117    0    1    0   
2            4    0    0   16   
3            0    5   11    0   
4            0    0    0    5   
5            0   15    0    0   
6          100    0  108    0   
7            0    0  147    0  

我想重新格式化此文件以使其具有两列，第一列是保持原样的位置列，第二个包含每个位置的最高频率。

理想输出:

Position    HighFreq
1                117
2                 16  
3                 11  
4                  5   
5                 15   
6                108  
7                147 

到目前为止，我拥有的是一个选择最大数字并打印的函数:

awk '{max=$1; for(i=2;i<=NF; i++) {if($i>max){max=$i;}};printf"%f\n",max}' file.tsv

我正在尝试为这个问题编写一个 bash 解决方案，但最受欢迎的是 Perl/Python!

Answer 1

$ perl -MList::Util=max -F/\t/ -lane 'print join "\t", $. == 1 ? qw(Position HighFreq) : ( $F [0], max(@F[1..$#F]) )'

说明

• -MList::Util=max

  加载List::Util::max

• -F/\t/-a

  激活自动分割并将分隔符设置为/\t/

• -lne

  自动附加适当的行结尾，应用单行，逐行处理 ARGV 输入

• 打印连接“\t”，...

  打印制表符分隔

• $. == 1 ? ...:...

  处理列标题

• max(@F[1..$#F])

  返回 @F 中除第一个元素之外的所有元素的最大值