我正在尝试实现 R 与 C 的简单集成。最初很简单:我想通过 .C
将值从 R 传递到内置于 .o 共享库中的 C 函数.Call
函数。 C 函数应该简单地打印通过 printf
传入的值。
这是我的 .Call
方法:
.Call("test", as.integer(5), as.character("A"), as.character("string_test"))
还有我的 C 代码:
#include <stdio.h>
void test(int integer, char character, char **str) {
printf("Integer: %i\nChar: %c\nString: %s\n", integer, character, *str);
}
但是当我通过控制台从 R 调用 C 函数(RStudio 崩溃)并启用 gdb
时,我收到:
Integer: 1466480376
Char: �
Float: -100407552.000000
String:
***caught segfault ***
address 0x20000090, cause 'memory not mapped'
Traceback:
1: .Call("test", as.integer(5), as.character("A"), as.character("string_test"))
好像这还不够,我们可以看到传入的值打印得非常奇怪。
我所做的一步一步的详细信息:
我使用 gcc
构建了 .o
共享库:
gcc -shared -o func_teste.o -fPIC func_teste.c
并准备好在 R 环境中动态加载:
$ R CMD SHLIB func_teste.o
gcc -m64 -I/usr/include/R -DNDEBUG -I/usr/local/include -fpic -O2 -g -pipe -Wall -Werror=format-security -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches -specs=/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-cc1 -m64 -mtune=generic -c func_teste.c -o func_teste.o
gcc -m64 -shared -L/usr/lib64/R/lib -Wl,-z,relro -specs=/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-ld -o func_teste.so func_teste.o -L/usr/lib64/R/lib -lR
最后,在 R 控制台内,我运行了:
>dyn.load('func_teste.o')
>.Call("test", as.integer(5), as.character("A"), as.character("string_test"))
有人知道为什么会发生这种情况吗?
最佳答案
R 提供了两个主要函数用于与 C 代码(以及 C++ 代码或任何其他能够使用 C 接口(interface)的语言)进行接口(interface):
- .C()
是使用 int*
、double*
等的旧接口(interface)
- .Call()
是使用 SEXP
对象的更新、更强大的接口(interface)
现在,.Call()
看起来更复杂,但它更强大也更安全。几乎普遍的共识是 .C()
不应再使用(请参阅 r-devel 列表和其他地方的各种讨论)。
.Call()
的主要缺点是您需要学习如何打包和解包您的值。或者......你作弊并让 Rcpp 为你做。因此,这里是 OP 示例的一行解决方案:
> library(Rcpp)
> cppFunction("void mytest(int i, char c, std::string str) { printf(\"Integer: %i Char: %c String: %s\\n\", i, c, str.c_str()); }")
> mytest(42L, 'Q', "a boat")
Integer: 42 Char: Q String: a boat
>
我将 char*
设为字符串。请注意,cppFunction()
需要对字符串进行转义,您可能需要查看sourceCpp()
和包以进行实际工作。 Rcpp 文档有详细信息。
关于c - 将值从 R 传递到 C 后,接收 *** 捕获段错误 ***、 'memory not mapped' 和损坏的结果,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/45259717/