我需要一次获取多个 rna 序列的图形特征值(例如大约 20)。
因此，如果我输入包含 rna 序列的文件，则输出文件中每个序列的每行应包含 20 个特征。我调查了 GraPPLE 但它一次只给出一个特征值。 igraph 的情况类似。
我有一个 500 个序列文件，我需要为其获取这些特征值，然后进一步训练它。
最佳答案
您可能想查看最近引用 GraPPLE 的文章:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2685108/citedby/
具体来说，RNAcon 也是基于图的方法:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24521294
最后，这篇评论可能会引起兴趣:
关于graph - 如何一次获取多个rna序列的图特征值？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/43109307/