mysql - 从包含2亿条记录的表中选择一些记录

Question

我是 sql 新手，所以我的术语可能不太正确。

我有一个 Alignment 表，其中有 2.5 亿条记录。它有两列 chain_id1 和 chain_id2。其中一些链是来自另一个具有 22000 条记录的 Centroid 表的 chain_id 的外键。

基本上我需要所有以两条链为质心的记录。

我尝试使用以下查询:

insert into NewAlignment(...) 
select .... 
from Alignment as A
   , Centroid  as C1
   , Centroid  as C2 
where (A.chain_id1 = C1.chain_id) 
  and (A.chain_id2 = C2.chain_id)

但是上面的查询只是停止，从表的大小来看这是可以理解的。

所以我尝试编写一个脚本来扫描表并检查值，然后插入新表。这样，1000000 条记录大约需要 13 分钟。

有什么办法可以加快速度吗？

非常感谢。

Answer 1

您可能需要向表添加索引，尤其是 Alignment.Chain_id1、Alignment.Chain_id2 和 Centroid.Chain_id 。这应该会有很大帮助。