r - 库不可写

Question

我在 Ubuntu 机器上安装 R 版本 3.0.2 (2013-09-25) 时遇到这个问题:

install.packages("randomForest")
Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable

如何解决？

Answer 1

对于 R 版本 3.2.2 (2015-08-14)，应该解决这个问题，因为 R 在安装过程中建议使用不同的路径来存储 R 库。安装看起来像这样: (这里以'random'作为示例包)

install.packages('random')

Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages("random") :
'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable

Would you like to use a personal library instead?  (y/n) y

Would you like to create a personal library
~/R/pc-linux-gnu-library/3.2
to install packages into?  (y/n) y

因此在安装过程中用“y”回答这两个问题应该会正确安装包。

19 年 1 月 18 日更新

如果您不想将 R 包存储在其他文件中:

作为Antoine-Sac和 Robert TheSim指出您可以将自己添加到员工组，以便能够写入“站点库”。 (点击名字可以看到他们的重要补充)

在此更新之前，我在此评论中提到了使用“chmod o+w”更改文件夹“site-library”的权限的选项，以便能够对其进行写入。假设存在安全问题但在我警告过它时无法确定，但主要是在等待有人解决这个问题。 Antoine-Sac 和 Robert TheSim have done so同时。谢谢!