我有一个简单的 python 脚本,可以打开一个 H5 文件,编辑一些数据并关闭它。由于某种原因,它在我第一次运行脚本时有效,但在第二次尝试时崩溃。
我原以为错误是我没有关闭文件,但实际上我这样做了。正如您在下面看到的,我编辑了名为 backR frontR 的字段,并创建了两个新字段“Manufacturer”和“Status”,然后关闭。
f = h5py.File(filename, 'r+')
backR = f['back_R']
backR[...] = SelectedBackCoat
frontR = f['front_R']
frontR[...] = SelectedFrontCoat
f.create_dataset('manufacturer', data=SelectedManu)
f.create_dataset('status', data=SelectedState)
f.close()
第二次为同一个文件运行脚本进行处理时,我得到以下结果:
File "h5py\h5f.pyx", line 85, in h5py.h5f.open
OSError: Unable to open file (file is already open for read-only)
最佳答案
文件仍然打开,也许您的脚本没有到达f.close()
?来自 this answer至 this question ,您可以尝试先强制关闭所有打开的文件。尽管您应该真正调试文件仍然打开的原因。
pytables (which h5py uses) keeps track of all open files and provides an easy method to force-close all open hdf5 files.
import tables
tables.file._open_files.close_all()
如果使用 with
语句,即使发生异常,也可以强制关闭文件:
with h5py.File(filename, 'r+') as f:
f.write(...)
关于python - 无法打开之前打开的H5,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/57146913/